55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3352 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  100 
 
 		 201 aa  401  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  50.48 
 
 		 247 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  47.17 
 
 		 249 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  35.92 
 
 		 182 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  33.55 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  46.88 
 
 		 260 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  46.88 
 
 		 260 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  39.36 
 
 		 171 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  51.04 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  36.67 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  36.23 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  48.96 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  34.83 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  31.25 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  36.84 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  31.25 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  38.61 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1810  restriction endonuclease  34.86 
 
 		 144 aa  62  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  32.11 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  32.11 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  37.89 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  29.41 
 
 		 520 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1848  restriction endonuclease  39.74 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  33.06 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  35.35 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  38.61 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  29.13 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  32.08 
 
 		 349 aa  55.1  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  29.89 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  24.86 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  34.34 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  29.51 
 
 		 368 aa  52  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  35.05 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  26.61 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  40 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  26.61 
 
 		 154 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  26.61 
 
 		 154 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  33 
 
 		 317 aa  48.5  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  26.61 
 
 		 125 aa  48.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  29.59 
 
 		 374 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  30.48 
 
 		 440 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  30.48 
 
 		 327 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  30.62 
 
 		 289 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  32.41 
 
 		 237 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  30.43 
 
 		 328 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  27.08 
 
 		 326 aa  45.1  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  32.97 
 
 		 1248 aa  45.1  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  29.89 
 
 		 364 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  31.18 
 
 		 346 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  27.1 
 
 		 421 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  27.63 
 
 		 287 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  27.52 
 
 		 493 aa  42  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  32.8 
 
 		 222 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  31.85 
 
 		 281 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 493 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>