More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0744 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0744  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 438 aa  852    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3377  diaminopimelate decarboxylase  54.82 
 
 		 452 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411773  normal  0.115373 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  48.92 
 
 		 415 aa  350  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  50.36 
 
 		 425 aa  349  6e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  46.89 
 
 		 421 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  46.89 
 
 		 421 aa  342  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  46.54 
 
 		 421 aa  343  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  47.48 
 
 		 421 aa  342  8e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  46.04 
 
 		 421 aa  338  8e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  46.99 
 
 		 417 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  47.74 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0481  diaminopimelate decarboxylase  45.12 
 
 		 421 aa  333  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  48.42 
 
 		 421 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  47.49 
 
 		 421 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  44.66 
 
 		 431 aa  329  7e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  47.37 
 
 		 423 aa  328  9e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  41.16 
 
 		 420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  46.59 
 
 		 421 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3213  diaminopimelate decarboxylase  47.83 
 
 		 432 aa  326  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  45.23 
 
 		 420 aa  326  6e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  47.37 
 
 		 421 aa  325  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1600  diaminopimelate decarboxylase  47.37 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.458641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  40.48 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  47.97 
 
 		 422 aa  324  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  46.89 
 
 		 415 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  45.43 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  44.55 
 
 		 419 aa  323  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0696  diaminopimelate decarboxylase  43.62 
 
 		 431 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  44.77 
 
 		 417 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  46.3 
 
 		 419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0716  diaminopimelate decarboxylase  43.39 
 
 		 431 aa  320  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.670894 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  42.69 
 
 		 443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  47.6 
 
 		 414 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  45.99 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  46.17 
 
 		 415 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  46.73 
 
 		 415 aa  318  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2862  diaminopimelate decarboxylase  47.28 
 
 		 423 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0197535  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  43.37 
 
 		 414 aa  317  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  47.69 
 
 		 421 aa  316  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  44.01 
 
 		 417 aa  316  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  45.5 
 
 		 423 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  46.72 
 
 		 421 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  47 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  43.8 
 
 		 417 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  43.07 
 
 		 417 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  43.8 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  42.12 
 
 		 443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  44.84 
 
 		 422 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  44.01 
 
 		 417 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  43.77 
 
 		 414 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  44.6 
 
 		 422 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  42.75 
 
 		 418 aa  311  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  45.37 
 
 		 421 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  43.66 
 
 		 417 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  44.71 
 
 		 415 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  44.71 
 
 		 415 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  47.22 
 
 		 414 aa  311  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  45.7 
 
 		 451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  47.19 
 
 		 418 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  43.07 
 
 		 414 aa  309  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  44.47 
 
 		 415 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  46.04 
 
 		 427 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  45.79 
 
 		 427 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  44.2 
 
 		 415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  41.93 
 
 		 414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  43.6 
 
 		 416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  44 
 
 		 414 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  42.22 
 
 		 417 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0541  diaminopimelate decarboxylase  39.76 
 
 		 421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.407931  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0777  diaminopimelate decarboxylase  43.26 
 
 		 427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  44.12 
 
 		 422 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  45.21 
 
 		 421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  45.56 
 
 		 418 aa  307  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  42.17 
 
 		 414 aa  307  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0992  diaminopimelate decarboxylase  43.87 
 
 		 427 aa  307  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0485  diaminopimelate decarboxylase  40 
 
 		 420 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  45.86 
 
 		 420 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  46.3 
 
 		 425 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  48.1 
 
 		 419 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  48.1 
 
 		 419 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  45.32 
 
 		 415 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  45.79 
 
 		 427 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  43.45 
 
 		 432 aa  305  9.000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  41.97 
 
 		 417 aa  305  9.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  41.77 
 
 		 445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  42.07 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2675  diaminopimelate decarboxylase  47.72 
 
 		 419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  42.56 
 
 		 429 aa  303  6.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  43.25 
 
 		 414 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  41.65 
 
 		 417 aa  302  7.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  43.25 
 
 		 414 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  40 
 
 		 447 aa  302  8.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  43.25 
 
 		 414 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  46.4 
 
 		 415 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2176  diaminopimelate decarboxylase  47.41 
 
 		 430 aa  302  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  40.14 
 
 		 418 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  42.86 
 
 		 415 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  42.18 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1983  diaminopimelate decarboxylase  45.45 
 
 		 421 aa  300  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1908  diaminopimelate decarboxylase  45.45 
 
 		 421 aa  300  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>