More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3293 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
385 aa  796    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
385 aa  295  7e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  41.94 
 
 
385 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 
385 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  37.66 
 
 
385 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  38.66 
 
 
386 aa  249  5e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 
388 aa  230  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  38.38 
 
 
395 aa  227  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 
378 aa  222  8e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 
390 aa  222  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  35.57 
 
 
378 aa  216  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 
382 aa  215  9e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  36.86 
 
 
392 aa  212  7e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 
378 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 
383 aa  209  7e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  35.18 
 
 
391 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 
373 aa  192  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  34.34 
 
 
394 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 
394 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
496 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 
500 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 
405 aa  182  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 
500 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 
492 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  36.22 
 
 
390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 
390 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  35.66 
 
 
390 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  35.92 
 
 
418 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  36.22 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  35.95 
 
 
418 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  36.39 
 
 
390 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  36.39 
 
 
390 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  35.95 
 
 
433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  36.04 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 
390 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  36.54 
 
 
392 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 
390 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 
390 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
390 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 
390 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 
390 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 
390 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  33.16 
 
 
398 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 
385 aa  155  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 
390 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
806 aa  153  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
816 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 
399 aa  149  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 
376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
823 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 
374 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
816 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 
394 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
376 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  27.93 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  28.19 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  28.38 
 
 
391 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 
401 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  28.19 
 
 
391 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
395 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 
799 aa  139  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
843 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1848  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
378 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
816 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  27.93 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  27.93 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 
825 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  27.93 
 
 
391 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 
801 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
805 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 
806 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
393 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 
831 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 
806 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
797 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 
396 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  31.19 
 
 
822 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  28.88 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  28.88 
 
 
831 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 
804 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 
815 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 
826 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 
819 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
398 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 
376 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 
441 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 
817 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  26.55 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
827 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 
398 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 
392 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 
398 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>