More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3118 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3118  OmpA/MotB family outer membrane protein  100 
 
 
242 aa  495  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0271  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.54 
 
 
328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.672755  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  44.07 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  45.1 
 
 
294 aa  88.6  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  42.31 
 
 
333 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  44.86 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1725  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.67 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.972471  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 
207 aa  82  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 
316 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.14 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  44.12 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  36.13 
 
 
523 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  42.98 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 
224 aa  79  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 
176 aa  79  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 
240 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 
210 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  42 
 
 
447 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  38.83 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  44.12 
 
 
261 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  39.62 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  40.78 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  34.19 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.15 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  44.12 
 
 
261 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  35.19 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  41.35 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  39.32 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  35.19 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  42.31 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  35.19 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  34.86 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 
333 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  35.19 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.94 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  41.35 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1803  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188621  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  35.19 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  35.19 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  40.19 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  43.27 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  35.19 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  35.19 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  34.71 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  34.71 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  37.74 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1172  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  37.62 
 
 
281 aa  75.1  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  39.45 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2141  OmpA/MotB domain-containing protein  26.19 
 
 
520 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0276844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  39.45 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  54.55 
 
 
429 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  33.33 
 
 
524 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  36.7 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 
459 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  32.48 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
560 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  37.14 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  43.69 
 
 
648 aa  73.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  37.8 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>