More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2479 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  42.81 
 
 		 1145 aa  731    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1115 aa  2198    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  75.91 
 
 		 1150 aa  1568    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  42.18 
 
 		 1098 aa  588  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.27 
 
 		 1124 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  41.49 
 
 		 1076 aa  536  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  38.54 
 
 		 1144 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  38.04 
 
 		 1062 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  37.54 
 
 		 1095 aa  502  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  36.71 
 
 		 1044 aa  499  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  39.15 
 
 		 1096 aa  499  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.38 
 
 		 1051 aa  492  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  33.97 
 
 		 1059 aa  491  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  37.05 
 
 		 1060 aa  489  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.95 
 
 		 1066 aa  479  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  35.91 
 
 		 1059 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  38.03 
 
 		 1050 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  35.48 
 
 		 1040 aa  459  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  35.6 
 
 		 1074 aa  445  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  37.5 
 
 		 1085 aa  421  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  34.69 
 
 		 1055 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.97 
 
 		 1083 aa  416  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  31.88 
 
 		 1134 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  34.6 
 
 		 1038 aa  382  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  32.03 
 
 		 1129 aa  379  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  33.73 
 
 		 1060 aa  376  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  32.63 
 
 		 1094 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  33.08 
 
 		 1051 aa  366  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  33.08 
 
 		 1051 aa  366  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  33.36 
 
 		 1051 aa  362  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  34.32 
 
 		 1103 aa  358  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  33.14 
 
 		 1038 aa  342  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.65 
 
 		 1058 aa  307  6e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  33.54 
 
 		 1197 aa  290  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  30.67 
 
 		 1099 aa  283  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  32.58 
 
 		 1135 aa  210  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  24.12 
 
 		 816 aa  103  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  26 
 
 		 707 aa  101  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.92 
 
 		 725 aa  99.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  23.43 
 
 		 721 aa  99  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  23.27 
 
 		 721 aa  96.3  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.05 
 
 		 662 aa  94.7  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  22.18 
 
 		 757 aa  94  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  24.53 
 
 		 817 aa  94  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.08 
 
 		 785 aa  92.4  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  23.91 
 
 		 770 aa  91.3  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.95 
 
 		 755 aa  90.9  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  24.17 
 
 		 723 aa  90.9  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.59 
 
 		 831 aa  89.7  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.35 
 
 		 672 aa  90.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.15 
 
 		 763 aa  89.7  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.38 
 
 		 715 aa  89  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  21.86 
 
 		 946 aa  89  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  27.25 
 
 		 706 aa  88.6  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  21.86 
 
 		 946 aa  89  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.19 
 
 		 718 aa  88.6  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.59 
 
 		 802 aa  87.8  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  27.92 
 
 		 804 aa  87.8  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0955  superfamily I DNA and RNA helicase  35.2 
 
 		 1428 aa  87.8  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  23.88 
 
 		 787 aa  86.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  24.07 
 
 		 825 aa  87  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  25.94 
 
 		 768 aa  87  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1413  DNA helicase II  25.1 
 
 		 858 aa  85.9  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.338777  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  24.18 
 
 		 722 aa  85.5  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.25 
 
 		 741 aa  85.5  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1369  DNA helicase II  24.97 
 
 		 858 aa  85.1  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261872  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.96 
 
 		 763 aa  85.5  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.11 
 
 		 759 aa  85.1  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  23.94 
 
 		 722 aa  85.1  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  23.94 
 
 		 722 aa  85.1  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  24 
 
 		 858 aa  84.7  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.07 
 
 		 732 aa  84.7  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  26.37 
 
 		 728 aa  84.7  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  25.04 
 
 		 688 aa  84.7  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.23 
 
 		 858 aa  84.7  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  23.99 
 
 		 826 aa  84.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  24.41 
 
 		 722 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1154  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1528 aa  83.6  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.193707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.62 
 
 		 739 aa  83.2  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.8 
 
 		 876 aa  83.2  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  24.75 
 
 		 771 aa  84  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.33 
 
 		 892 aa  82.8  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.84 
 
 		 756 aa  83.2  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.76 
 
 		 694 aa  83.2  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.82 
 
 		 748 aa  82.8  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  24.57 
 
 		 730 aa  82.8  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  23.55 
 
 		 728 aa  82.8  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  23.55 
 
 		 722 aa  82.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  25.46 
 
 		 816 aa  82.4  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  22.97 
 
 		 1019 aa  82.8  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  20.98 
 
 		 731 aa  82  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  23.98 
 
 		 720 aa  82.4  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.65 
 
 		 742 aa  82  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0748  UvrD/REP helicase  23.64 
 
 		 653 aa  82  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00311747  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.16 
 
 		 858 aa  81.6  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  27.09 
 
 		 741 aa  81.3  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  28.33 
 
 		 1032 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.24 
 
 		 729 aa  80.9  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2024  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.85 
 
 		 814 aa  81.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260389  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  21.98 
 
 		 724 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>