More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0195 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  31.49 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 
259 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  35.34 
 
 
233 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 
264 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 
264 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  35.48 
 
 
232 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
262 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  31.13 
 
 
265 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
241 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 
275 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  31.93 
 
 
238 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  36.14 
 
 
228 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
228 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  34.51 
 
 
238 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.5 
 
 
256 aa  98.6  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  28.88 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  28.09 
 
 
254 aa  97.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  30.67 
 
 
239 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  32.27 
 
 
241 aa  97.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  26.69 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
254 aa  96.3  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  29.76 
 
 
266 aa  95.9  7e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 
254 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 
233 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
233 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  31.51 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 
233 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  33.97 
 
 
237 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  33.18 
 
 
220 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  34.35 
 
 
240 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  26.97 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.41 
 
 
280 aa  94  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  30.23 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  31.12 
 
 
244 aa  92.8  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 
239 aa  92.8  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
265 aa  92.4  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 
244 aa  92  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  29 
 
 
273 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 
250 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  27.66 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2854  transcriptional regulator, IclR family  30.22 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  32.61 
 
 
233 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  34.4 
 
 
233 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  27.57 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  30.6 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  24.58 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  29.66 
 
 
244 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.17 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  26.23 
 
 
249 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
268 aa  89.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 
250 aa  89.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
261 aa  89.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 
239 aa  89  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  32.72 
 
 
239 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
250 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  25.49 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  25.73 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  32.37 
 
 
258 aa  87.8  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  27 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  24.38 
 
 
258 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
239 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  26.5 
 
 
286 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  24.17 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  24.17 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  25.2 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  23.75 
 
 
250 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  24.34 
 
 
267 aa  85.9  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 
254 aa  85.9  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  30.47 
 
 
252 aa  85.5  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  23.87 
 
 
263 aa  85.5  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  29.57 
 
 
254 aa  85.5  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  23.75 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  25.28 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  23.75 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  23.87 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  30.53 
 
 
233 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  25.58 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  23.87 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  29.33 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  27.03 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  24.69 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  24.5 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>