More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3992 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3992  response regulator receiver protein  100 
 
 
153 aa  311  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.383415  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3827  response regulator receiver protein  69.23 
 
 
122 aa  171  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.21592  normal  0.16634 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0651  response regulator receiver protein  66.94 
 
 
138 aa  157  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0630  response regulator receiver protein  66.12 
 
 
123 aa  157  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
887 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1226  response regulator receiver protein  46.08 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915128  normal  0.471544 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
782 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0852  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 
1055 aa  70.5  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1735  response regulator receiver protein  39.47 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  33.06 
 
 
454 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
1016 aa  67.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  32.81 
 
 
236 aa  67.4  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 
759 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0137592  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0372  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  39.02 
 
 
461 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2507  response regulator receiver protein  34.82 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7023  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
763 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180026  hitchhiker  0.00000131204 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5171  histidine kinase  36.72 
 
 
584 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.944283 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
781 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2004  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  50 
 
 
478 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1655  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.05 
 
 
462 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000025661  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.74 
 
 
630 aa  64.3  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3251  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.06 
 
 
465 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1999  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.45 
 
 
481 aa  63.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
1415 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 
581 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
750 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
1059 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0241  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.62 
 
 
582 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3740  putative PAS/PAC sensor protein  34.17 
 
 
1109 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0863  response regulator receiver protein  34.75 
 
 
118 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 
776 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.12 
 
 
727 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  37.07 
 
 
254 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1635  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.8 
 
 
457 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.12 
 
 
727 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
727 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
662 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2591  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.8 
 
 
457 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313706  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.5 
 
 
470 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
732 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0842  sensory box histidine kinase/response regulator  40.24 
 
 
787 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2678  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.2 
 
 
457 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2109  sensor histidine kinase/response regulator  31.76 
 
 
767 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00292967  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1496  sensor histidine kinase/response regulator  31.76 
 
 
725 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000109142  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
817 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  36.79 
 
 
1164 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  38.74 
 
 
1427 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3110  response regulator receiver protein  33.05 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568252  normal  0.771305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
1164 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0684  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 
456 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1417  sensor histidine kinase/response regulator  31.76 
 
 
767 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000575152  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2403  sensor histidine kinase/response regulator  31.76 
 
 
760 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00669702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3282  sensor histidine kinase/response regulator  31.76 
 
 
760 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0788114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  32.89 
 
 
1112 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
750 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2506  histidine kinase  32.17 
 
 
538 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.971833  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2629  two component signal transduction response regulator  31.06 
 
 
238 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0010  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
764 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00266104  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3071  response regulator receiver protein  32.06 
 
 
304 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000348024  unclonable  0.0000000210343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3407  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.64 
 
 
458 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0984  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  27.87 
 
 
564 aa  59.3  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 
770 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
1426 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
942 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 
226 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5171  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
749 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00341574  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2532  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 
794 aa  59.7  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.108241  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3169  sensor histidine kinase/response regulator  31.76 
 
 
760 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5688  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
749 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00115642  decreased coverage  0.000406473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29000  sigma54-dependent response regulator, two-component  36.67 
 
 
472 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.99042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2521  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.1 
 
 
457 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4405  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.91 
 
 
448 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.851623  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1137  sensor histidine kinase/response regulator  31.76 
 
 
760 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1960  response regulator transcription factor  35.44 
 
 
471 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  35.05 
 
 
1036 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3167  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
758 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000450225  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.62 
 
 
1195 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
1011 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1530  response regulator receiver protein  35.8 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.754323  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1698  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.1 
 
 
457 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000740904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 
689 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 
991 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  34.26 
 
 
1268 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1316  response regulator  39.51 
 
 
324 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30 
 
 
472 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4029  response regulator receiver protein  32.48 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2035  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
750 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 
809 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1993  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.83 
 
 
486 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 
650 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 
233 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3046  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.73 
 
 
365 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0429754  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4240  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 
225 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.735778  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4284  response regulator receiver protein  29.84 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2084  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  32.65 
 
 
477 aa  57.8  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2816  response regulator receiver protein  28.97 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101903  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3429  histidine kinase  31.47 
 
 
538 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0639  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.44 
 
 
455 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1263  response regulator receiver protein  36.94 
 
 
197 aa  57.4  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0848  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
698 aa  57.4  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132769  normal  0.98666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>