59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2335 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  100 
 
 		 245 aa  500  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  38.71 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  34.87 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  26.85 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  29.85 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  30.36 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  30.36 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000855833  hitchhiker  0.0000527672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  30.14 
 
 		 289 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131906  hitchhiker  0.000000754842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  31.29 
 
 		 273 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  29.37 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  24.9 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  29.93 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  25.58 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3398  putative phage repressor  30.82 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0077186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  27.4 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  24.79 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  27.24 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  28.97 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  26.1 
 
 		 237 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  26.1 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  33.33 
 
 		 144 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  25.22 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2394  Cro/CI family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 283 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  32.35 
 
 		 289 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  44.26 
 
 		 488 aa  48.9  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1976  transcriptional regulator, XRE family  26.79 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  29.41 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  26.12 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  35.4 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  25.82 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  32.98 
 
 		 204 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  36.17 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  25.87 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  32.18 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  32.74 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0258  putative phage repressor  25.81 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  23.22 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  26.95 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  27.49 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  26.01 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  23.67 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  39.66 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2007  DNA-binding protein  44.64 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  33.7 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3859  hypothetical protein  39.13 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1066  putative phage repressor  29.25 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000341462  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  24.24 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0958  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 132 aa  42.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2295  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 106 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.302272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5157  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 107 aa  42  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086798  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 199 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 215 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  25 
 
 		 212 aa  41.6  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>