More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1821 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1821  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
524 aa  1004    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1426  carbohydrate kinase, YjeF related protein  60.11 
 
 
514 aa  480  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1220  carbohydrate kinase, YjeF related protein  65.23 
 
 
505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2588  carbohydrate kinase, YjeF related protein  65.42 
 
 
508 aa  450  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.236021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4950  carbohydrate kinase, YjeF related protein  56.1 
 
 
525 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.433467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.3 
 
 
517 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2698  hypothetical protein  57.41 
 
 
523 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.391091 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1984  hypothetical protein  57 
 
 
487 aa  399  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2596  carbohydrate kinase, YjeF related protein  56.58 
 
 
486 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1982  hypothetical protein  51.66 
 
 
510 aa  345  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0776556 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2854  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.3 
 
 
548 aa  290  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.212974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.46 
 
 
529 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  46.43 
 
 
531 aa  272  9e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.47 
 
 
531 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.02 
 
 
531 aa  270  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  43.85 
 
 
535 aa  259  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  43.57 
 
 
526 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5217  hypothetical protein  44.06 
 
 
514 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6163  hypothetical protein  45.59 
 
 
514 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1916  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.59 
 
 
514 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2346  carbohydrate kinase family protein  45.53 
 
 
531 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1448  carbohydrate kinase, putative  45.53 
 
 
531 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1941  putative carbohydrate kinase  45.53 
 
 
531 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1214  putative carbohydrate kinase  45.53 
 
 
531 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3364  putative carbohydrate kinase  45.53 
 
 
531 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.36405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2307  nitric-oxide reductase subunit C  45.53 
 
 
531 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2465  sugar kinase  45.33 
 
 
531 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1020  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.89 
 
 
530 aa  243  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2133  carbohydrate kinase, putative  46.06 
 
 
531 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217143  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.74 
 
 
514 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1939  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.25 
 
 
514 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643573  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  41.93 
 
 
533 aa  240  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1834  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.11 
 
 
514 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  40.36 
 
 
506 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  39.75 
 
 
522 aa  221  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1358  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.35 
 
 
514 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624281  normal  0.973105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  36.06 
 
 
514 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  36.06 
 
 
514 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  34.5 
 
 
510 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  36.06 
 
 
514 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  36.06 
 
 
514 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  36.06 
 
 
514 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  41.6 
 
 
487 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.5 
 
 
515 aa  200  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  34.5 
 
 
510 aa  200  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  34.5 
 
 
515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  34.31 
 
 
510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  34.5 
 
 
515 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  34.5 
 
 
515 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  34.5 
 
 
515 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  34.11 
 
 
515 aa  196  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.96 
 
 
513 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.28 
 
 
502 aa  194  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  35.51 
 
 
510 aa  193  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  36.82 
 
 
462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  33.59 
 
 
504 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.63 
 
 
499 aa  183  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  34.4 
 
 
514 aa  183  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  36.99 
 
 
513 aa  183  8.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  33.4 
 
 
504 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  33.21 
 
 
504 aa  182  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  33.4 
 
 
508 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  35.05 
 
 
513 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  35.22 
 
 
503 aa  176  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  33.19 
 
 
498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.24 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  35.34 
 
 
512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  34.56 
 
 
494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  32.19 
 
 
490 aa  170  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  33.6 
 
 
488 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
519 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  40.73 
 
 
482 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.89 
 
 
520 aa  167  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.68 
 
 
513 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  33.6 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.62 
 
 
533 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.89 
 
 
520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.38 
 
 
515 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.22 
 
 
514 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.19 
 
 
499 aa  161  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.25 
 
 
500 aa  161  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  25.95 
 
 
499 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  28.95 
 
 
517 aa  160  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  36.77 
 
 
502 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.23 
 
 
485 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  34.53 
 
 
496 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.19 
 
 
494 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.73 
 
 
530 aa  156  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  25.38 
 
 
499 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.21 
 
 
509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.3 
 
 
504 aa  154  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.87 
 
 
492 aa  154  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  35.05 
 
 
490 aa  154  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0520  hypothetical protein  31.87 
 
 
586 aa  154  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.75104  decreased coverage  0.0023767 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  33.86 
 
 
514 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.04 
 
 
492 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  33.85 
 
 
519 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  34.45 
 
 
499 aa  152  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  35.38 
 
 
530 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  32.86 
 
 
522 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>