231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1243 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  100 
 
 
863 aa  1744  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  62.69 
 
 
854 aa  1033  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  69.89 
 
 
854 aa  1179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  97.68 
 
 
863 aa  1713  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  34.99 
 
 
870 aa  506  1e-142  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  36.43 
 
 
872 aa  501  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  35.84 
 
 
881 aa  491  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  36.08 
 
 
880 aa  489  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  35.96 
 
 
880 aa  488  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  37.03 
 
 
872 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  36.07 
 
 
869 aa  479  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  36 
 
 
867 aa  459  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  39.42 
 
 
855 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  34.9 
 
 
867 aa  452  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  37.44 
 
 
877 aa  447  1e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  37.44 
 
 
877 aa  447  1e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  35.11 
 
 
877 aa  445  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  38.12 
 
 
864 aa  441  1e-122  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  36.7 
 
 
866 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  34.92 
 
 
875 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  35.19 
 
 
871 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  33.53 
 
 
850 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  35.03 
 
 
880 aa  429  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  35.19 
 
 
871 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  37.67 
 
 
844 aa  426  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  33.45 
 
 
850 aa  422  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.74946e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  34.27 
 
 
880 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  33.17 
 
 
850 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  34.84 
 
 
880 aa  419  1e-115  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  39.61 
 
 
883 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  32.09 
 
 
813 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  37.85 
 
 
844 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  35.42 
 
 
880 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  34.8 
 
 
879 aa  407  1e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  34.9 
 
 
880 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  34.9 
 
 
880 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  33.74 
 
 
850 aa  401  1e-110  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  33.29 
 
 
864 aa  401  1e-110  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  34.94 
 
 
864 aa  400  1e-110  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  32.98 
 
 
850 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  33.41 
 
 
850 aa  386  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  32.54 
 
 
850 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  32.94 
 
 
850 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  35.27 
 
 
876 aa  382  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  32.23 
 
 
864 aa  379  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  35.53 
 
 
881 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  31.6 
 
 
864 aa  373  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  31.85 
 
 
889 aa  363  9e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  31.85 
 
 
889 aa  363  9e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  35.53 
 
 
881 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  31.85 
 
 
889 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  37.31 
 
 
739 aa  362  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  34.72 
 
 
850 aa  347  7e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  32.03 
 
 
896 aa  345  3e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  31.39 
 
 
864 aa  344  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  31.64 
 
 
864 aa  343  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  36.36 
 
 
557 aa  283  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  29.15 
 
 
861 aa  275  2e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88659e-07 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  29.15 
 
 
861 aa  276  2e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  29.15 
 
 
861 aa  275  2e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  29.15 
 
 
861 aa  275  2e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  29.15 
 
 
861 aa  276  2e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  29.57 
 
 
859 aa  275  2e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  29.3 
 
 
859 aa  275  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.41179e-10 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  29.26 
 
 
861 aa  275  4e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  27.57 
 
 
851 aa  274  6e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  28.98 
 
 
861 aa  273  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  28.71 
 
 
861 aa  270  8e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  27.33 
 
 
851 aa  267  5e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  30.5 
 
 
858 aa  265  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  42.86 
 
 
346 aa  258  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  26.35 
 
 
840 aa  240  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  26.35 
 
 
840 aa  240  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  29.35 
 
 
569 aa  239  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  27.22 
 
 
840 aa  236  1e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  39.63 
 
 
429 aa  231  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  30.66 
 
 
556 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  26.81 
 
 
851 aa  221  5e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  26.27 
 
 
844 aa  218  3e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  25.24 
 
 
847 aa  217  9e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  37.22 
 
 
395 aa  214  6e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  31.23 
 
 
556 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  31.23 
 
 
556 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  34.64 
 
 
590 aa  199  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  33.23 
 
 
861 aa  192  3e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  35.63 
 
 
568 aa  190  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  30.22 
 
 
584 aa  177  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  26.86 
 
 
692 aa  173  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  26.26 
 
 
861 aa  165  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  24.41 
 
 
875 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  29.18 
 
 
516 aa  160  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  31.58 
 
 
862 aa  160  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  30.97 
 
 
517 aa  159  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  6.34893e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  31.97 
 
 
314 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  29.05 
 
 
312 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  30.25 
 
 
313 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1469  hypothetical protein  30.72 
 
 
368 aa  136  2e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0291454  normal  0.344342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4466  hypothetical protein  30.46 
 
 
363 aa  130  1e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1656  hypothetical protein  30.15 
 
 
353 aa  127  8e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0333336  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3833  hypothetical protein  29.97 
 
 
353 aa  126  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00492954  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>