39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0008 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  97.23 
 
 		 397 aa  707    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  790    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03477  tetratricopeptide repeat domain protein  69.35 
 
 		 397 aa  484  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  62.89 
 
 		 395 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  26.69 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  26.35 
 
 		 404 aa  90.9  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 		 415 aa  86.7  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  24.26 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  24.28 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  23.64 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  22.25 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  23.44 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  23.68 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  22.71 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  23.74 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  25.28 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  22.26 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  22.87 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  22.01 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  24.6 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  21.74 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 1297 aa  52.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  25.58 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2343  hypothetical protein  21.94 
 
 		 452 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.69253  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 562 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.59 
 
 		 804 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  24 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  22.1 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.75 
 
 		 762 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  27.75 
 
 		 762 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>