More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0520 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  437  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  53.14 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  49.27 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  49.04 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 223 aa  187  8e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  52.61 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  52.61 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  48.56 
 
 		 216 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  56.52 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  49.76 
 
 		 230 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  49.03 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  47.25 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  52.61 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  44.44 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  43.81 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  43.43 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  40.39 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  41.87 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  41.87 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  41.62 
 
 		 237 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  40.1 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 227 aa  128  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 244 aa  121  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 222 aa  121  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  38.74 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 248 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  38.59 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  38.54 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  36.51 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  37.82 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 		 229 aa  104  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  37.95 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  38.59 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 249 aa  99  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 239 aa  99  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 229 aa  98.6  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 244 aa  98.2  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>