More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1271 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 262 aa  528  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.29 
 
 		 260 aa  394  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  70.38 
 
 		 269 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.11 
 
 		 269 aa  358  6e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  69.81 
 
 		 269 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.09 
 
 		 269 aa  352  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.45 
 
 		 273 aa  345  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.8 
 
 		 269 aa  345  4e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  70.73 
 
 		 269 aa  345  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  69.11 
 
 		 269 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  67.05 
 
 		 267 aa  329  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.46 
 
 		 272 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.41 
 
 		 269 aa  326  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  63.67 
 
 		 280 aa  323  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  65.06 
 
 		 272 aa  323  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  63.64 
 
 		 269 aa  318  7.999999999999999e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  61.02 
 
 		 262 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  61 
 
 		 266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  61.69 
 
 		 272 aa  304  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  61.69 
 
 		 272 aa  304  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  59.07 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  59.07 
 
 		 261 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  60.23 
 
 		 278 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  58.69 
 
 		 261 aa  301  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  59.39 
 
 		 264 aa  300  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  59.16 
 
 		 264 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  60.16 
 
 		 264 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  59.16 
 
 		 290 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  59.16 
 
 		 290 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  59 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  57.14 
 
 		 265 aa  294  9e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  58.69 
 
 		 264 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.88 
 
 		 274 aa  292  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  60.55 
 
 		 257 aa  279  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  57.31 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.43 
 
 		 273 aa  271  8.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.89 
 
 		 261 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  55.91 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  57.6 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  52.92 
 
 		 261 aa  259  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  56.32 
 
 		 275 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  54.79 
 
 		 275 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  53.31 
 
 		 261 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  55.12 
 
 		 261 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  51.75 
 
 		 264 aa  258  9e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.44 
 
 		 263 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.22 
 
 		 265 aa  256  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.08 
 
 		 266 aa  254  8e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.21 
 
 		 275 aa  248  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  52.27 
 
 		 275 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.64 
 
 		 276 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  50.97 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  52.08 
 
 		 275 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  48.26 
 
 		 262 aa  244  9e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  50.76 
 
 		 266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.74 
 
 		 260 aa  232  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.67 
 
 		 266 aa  230  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.69 
 
 		 270 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.64 
 
 		 260 aa  225  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  53.88 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.02 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.69 
 
 		 265 aa  215  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  46.51 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  46.3 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.07 
 
 		 270 aa  198  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  48.19 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.67 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.5 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  45.85 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.61 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.44 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  42.75 
 
 		 263 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.16 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  36.74 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  36.74 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0041  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568565  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1173  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2511  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1150  enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 		 260 aa  141  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.283717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.52 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.98 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  39.23 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3459  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>