207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0503 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  100 
 
 		 572 aa  1153    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  38.51 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.25 
 
 		 554 aa  289  8e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.17 
 
 		 554 aa  286  5e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  35.69 
 
 		 550 aa  277  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.65 
 
 		 567 aa  272  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.39 
 
 		 578 aa  264  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  33.33 
 
 		 548 aa  263  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  33.08 
 
 		 554 aa  261  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  34.44 
 
 		 607 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.84 
 
 		 545 aa  259  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.99 
 
 		 561 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.75 
 
 		 585 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  33.01 
 
 		 556 aa  243  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.99 
 
 		 586 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.33 
 
 		 583 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.17 
 
 		 569 aa  234  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  27.78 
 
 		 567 aa  211  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  33.75 
 
 		 545 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  27.59 
 
 		 567 aa  210  6e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  27.59 
 
 		 567 aa  210  6e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  32.17 
 
 		 442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.91 
 
 		 571 aa  195  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  29.94 
 
 		 596 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.94 
 
 		 596 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.81 
 
 		 595 aa  190  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.47 
 
 		 592 aa  190  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  29.94 
 
 		 596 aa  189  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  27.57 
 
 		 576 aa  182  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  32.96 
 
 		 575 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.39 
 
 		 590 aa  179  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  27.09 
 
 		 576 aa  164  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  29.17 
 
 		 581 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.52 
 
 		 692 aa  164  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.34 
 
 		 574 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.38 
 
 		 747 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.57 
 
 		 546 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.33 
 
 		 567 aa  136  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  24.95 
 
 		 551 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  24.95 
 
 		 551 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.46 
 
 		 559 aa  130  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  25.96 
 
 		 568 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  25.59 
 
 		 568 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  28.16 
 
 		 508 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  23.71 
 
 		 585 aa  128  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  24.7 
 
 		 588 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.74 
 
 		 553 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  27.35 
 
 		 599 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  25.85 
 
 		 597 aa  120  9e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  25.42 
 
 		 584 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  26.75 
 
 		 558 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  25.78 
 
 		 692 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  25.74 
 
 		 608 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.19 
 
 		 1570 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  26.13 
 
 		 557 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  26.2 
 
 		 558 aa  110  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.77 
 
 		 1391 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0771  polypeptide-transport-associated domain protein, ShlB-type  29.39 
 
 		 310 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.891277 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.55 
 
 		 1349 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.45 
 
 		 561 aa  103  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  24.65 
 
 		 561 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.65 
 
 		 561 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  24.32 
 
 		 561 aa  103  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0055  hemolysin activation/secretion protein-like  26.71 
 
 		 533 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.87 
 
 		 561 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.27 
 
 		 561 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  25.66 
 
 		 555 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.61 
 
 		 561 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  25.46 
 
 		 590 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.32 
 
 		 581 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.32 
 
 		 581 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  25.28 
 
 		 568 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  23.78 
 
 		 565 aa  99.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.77 
 
 		 561 aa  99  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  23.17 
 
 		 551 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  23.17 
 
 		 551 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  23.17 
 
 		 551 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  23.17 
 
 		 559 aa  97.8  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  23.17 
 
 		 559 aa  97.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  23.17 
 
 		 551 aa  97.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  23.17 
 
 		 551 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  24.05 
 
 		 558 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  23.24 
 
 		 597 aa  95.9  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  24.49 
 
 		 595 aa  95.1  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  24.49 
 
 		 595 aa  95.1  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  25.28 
 
 		 568 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.3 
 
 		 580 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.74 
 
 		 569 aa  92  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.75 
 
 		 538 aa  91.3  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.87 
 
 		 558 aa  89  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  21.81 
 
 		 555 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  24.36 
 
 		 565 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.04 
 
 		 573 aa  88.2  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.51 
 
 		 560 aa  88.2  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  25.89 
 
 		 607 aa  88.2  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  24.15 
 
 		 562 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  24.15 
 
 		 562 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  24.15 
 
 		 562 aa  87  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.12 
 
 		 584 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  22.78 
 
 		 569 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>