More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0066 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
179 aa  361  4e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  43.4 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.31 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  40.59 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 
180 aa  124  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.41 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 
178 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  35.47 
 
 
182 aa  114  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.69 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.9 
 
 
178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
180 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
180 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
180 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.08 
 
 
180 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  32.75 
 
 
182 aa  104  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.43 
 
 
179 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.96 
 
 
180 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.96 
 
 
180 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  34.71 
 
 
176 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.96 
 
 
180 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.89 
 
 
179 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.43 
 
 
179 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  32.35 
 
 
178 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.37 
 
 
182 aa  101  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.57 
 
 
184 aa  101  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  33.72 
 
 
177 aa  100  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
179 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.88 
 
 
180 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.91 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.4 
 
 
181 aa  99  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 
179 aa  99  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.36 
 
 
182 aa  98.2  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 
179 aa  97.4  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  32.4 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.75 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  36 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.72 
 
 
180 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  31.64 
 
 
178 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2145  ATP synthase F1, delta subunit  30.51 
 
 
185 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 
182 aa  96.3  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.64 
 
 
182 aa  95.1  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
179 aa  94.7  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5203  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.39 
 
 
178 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.021535  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 
180 aa  94.4  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.6 
 
 
178 aa  94.4  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
178 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
178 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.6 
 
 
178 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
179 aa  94  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 
181 aa  94  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.18 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0179  ATP synthase delta chain  29.94 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  31.25 
 
 
178 aa  92  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
178 aa  92  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.92 
 
 
180 aa  92  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.78 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.17 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.6 
 
 
178 aa  91.3  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.16 
 
 
180 aa  90.9  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.51 
 
 
182 aa  91.3  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  33.92 
 
 
182 aa  90.9  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52190  F1 sector of membrane-bound ATP synthase, delta subunit  32.54 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.51 
 
 
182 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  34.91 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  31.43 
 
 
201 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3206  ATP synthase F1, delta subunit  31.64 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2810  ATP synthase F1, delta subunit  31.64 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.706579  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  31.36 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
186 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
178 aa  88.6  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5733  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
178 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607755  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
180 aa  88.2  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.68 
 
 
177 aa  87.8  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
180 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
180 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
180 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.72 
 
 
178 aa  87.8  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  34.71 
 
 
190 aa  87.4  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0009  ATP synthase F1, delta subunit  30.39 
 
 
178 aa  87  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.49 
 
 
178 aa  87.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 
183 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
186 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
186 aa  87  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.56 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  29.48 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.78 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>