More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0712 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
624 aa  1249    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.19 
 
 
637 aa  323  8e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.01 
 
 
636 aa  297  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.16 
 
 
650 aa  296  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.67 
 
 
638 aa  289  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  46.26 
 
 
713 aa  282  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.33 
 
 
637 aa  280  6e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  45.88 
 
 
712 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.4 
 
 
716 aa  278  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
555 aa  277  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  45.33 
 
 
712 aa  276  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  45.69 
 
 
633 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  54.18 
 
 
523 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.67 
 
 
679 aa  273  9e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.09 
 
 
640 aa  272  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.86 
 
 
543 aa  270  7e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.33 
 
 
541 aa  270  7e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  43.6 
 
 
642 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.39 
 
 
674 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.18 
 
 
552 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.2 
 
 
544 aa  267  5e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.24 
 
 
541 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.03 
 
 
619 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.93 
 
 
642 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.13 
 
 
638 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.92 
 
 
638 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.22 
 
 
638 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.22 
 
 
638 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  46.71 
 
 
647 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  47.23 
 
 
647 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.93 
 
 
640 aa  261  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 
647 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.71 
 
 
647 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.99 
 
 
647 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  45.1 
 
 
629 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.22 
 
 
543 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.43 
 
 
739 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.2 
 
 
646 aa  259  9e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.98 
 
 
552 aa  259  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.32 
 
 
638 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  42.78 
 
 
546 aa  257  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.8 
 
 
634 aa  256  8e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 
681 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  44 
 
 
541 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46 
 
 
541 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.89 
 
 
541 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4403  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.48 
 
 
670 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604884  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  36.83 
 
 
634 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.89 
 
 
541 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.36 
 
 
676 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.26 
 
 
640 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.89 
 
 
541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  48.26 
 
 
647 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.13 
 
 
639 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  46.4 
 
 
640 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1999  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.24 
 
 
405 aa  253  8.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  42.86 
 
 
541 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.52 
 
 
634 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.87 
 
 
539 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.4 
 
 
640 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4192  chemotaxis sensory transducer  44.94 
 
 
654 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.3 
 
 
548 aa  252  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3979  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.18 
 
 
552 aa  251  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  43.87 
 
 
539 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.39 
 
 
541 aa  251  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.18 
 
 
552 aa  251  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.4 
 
 
411 aa  250  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.22 
 
 
653 aa  250  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.84 
 
 
541 aa  250  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  44.99 
 
 
550 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.17 
 
 
541 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 
634 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  45.85 
 
 
541 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.48 
 
 
564 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  45.58 
 
 
672 aa  248  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.28 
 
 
541 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  44.62 
 
 
676 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1150  chemotaxis sensory transducer  43.51 
 
 
551 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.37 
 
 
542 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.93 
 
 
674 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.21 
 
 
425 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  35.82 
 
 
541 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0859  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.86 
 
 
673 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.88 
 
 
541 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000055  methyl-accepting chemotaxis protein  39.49 
 
 
543 aa  244  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000458726  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.26 
 
 
540 aa  244  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.88 
 
 
541 aa  244  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0789  chemotaxis sensory transducer  45.04 
 
 
676 aa  243  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2526  methyl-accepting chemotaxis protein  39.55 
 
 
559 aa  243  7e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.591236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48 
 
 
639 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.61 
 
 
541 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.73 
 
 
647 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.55 
 
 
542 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.31 
 
 
639 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.38 
 
 
568 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  45.85 
 
 
639 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.61 
 
 
541 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.55 
 
 
522 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.69 
 
 
639 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  42.94 
 
 
541 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>