More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2554 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
667 aa  1327    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  49.93 
 
 
652 aa  551  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5141  beta-lactamase domain-containing protein  46.97 
 
 
577 aa  344  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265268  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  32.1 
 
 
821 aa  209  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 
830 aa  201  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  28.2 
 
 
433 aa  178  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  28.61 
 
 
433 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  28.81 
 
 
635 aa  171  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
426 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 
515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 
433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 
642 aa  164  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 
433 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 
432 aa  161  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.08 
 
 
450 aa  153  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1883  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 
456 aa  151  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 
635 aa  151  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 
635 aa  151  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.99 
 
 
410 aa  150  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  30.02 
 
 
428 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
422 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  27.76 
 
 
422 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  30.54 
 
 
422 aa  148  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 
635 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  28.13 
 
 
635 aa  147  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 
425 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 
422 aa  147  9e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  29.74 
 
 
411 aa  146  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  27.51 
 
 
635 aa  146  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  31.04 
 
 
411 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  28.47 
 
 
425 aa  145  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  26.22 
 
 
421 aa  145  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 
636 aa  145  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  31.5 
 
 
468 aa  145  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 
421 aa  144  7e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  28.41 
 
 
447 aa  143  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  28.64 
 
 
411 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  27.07 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  33.1 
 
 
414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  30.12 
 
 
428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
634 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3180  beta-lactamase domain-containing protein  29.21 
 
 
452 aa  140  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  30.26 
 
 
813 aa  140  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 
570 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  32.37 
 
 
461 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  28.87 
 
 
644 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 
457 aa  138  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 
429 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 
639 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.35 
 
 
432 aa  135  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 
640 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  28.05 
 
 
452 aa  134  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  32.23 
 
 
460 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 
630 aa  134  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  32.75 
 
 
460 aa  134  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 
455 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  27.78 
 
 
470 aa  133  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  27.56 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 
641 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  26.65 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  26.91 
 
 
767 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 
455 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 
639 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 
430 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  28.34 
 
 
637 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  30.68 
 
 
452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0265  putative metallo-beta-lactamase  26.43 
 
 
484 aa  131  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 
421 aa  132  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  27.75 
 
 
644 aa  131  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 
635 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  27.45 
 
 
647 aa  131  5.0000000000000004e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 
452 aa  131  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  27.16 
 
 
397 aa  130  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  27.19 
 
 
602 aa  130  7.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 
634 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.25 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  29.12 
 
 
630 aa  128  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 
531 aa  128  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25 
 
 
465 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  29.98 
 
 
468 aa  127  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 
635 aa  127  6e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 
641 aa  127  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  27.9 
 
 
629 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  28.96 
 
 
455 aa  126  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 
640 aa  126  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  31.52 
 
 
452 aa  126  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2642  hypothetical protein  27.81 
 
 
455 aa  126  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  29.31 
 
 
603 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3425  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.21 
 
 
451 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  29.4 
 
 
467 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  26.62 
 
 
451 aa  125  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  30.55 
 
 
472 aa  125  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  25.55 
 
 
525 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  29.31 
 
 
472 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 
646 aa  125  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  29.09 
 
 
459 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 
452 aa  124  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>