More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0075 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  627  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  40.07 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  39.35 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  39.35 
 
 		 318 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  39.71 
 
 		 314 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  38.08 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  37.46 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  37.46 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  38.08 
 
 		 314 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  38.08 
 
 		 314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  36.82 
 
 		 328 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  36.23 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  37.01 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  35.51 
 
 		 303 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  35.09 
 
 		 393 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  35 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  38.01 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  36.96 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  36.43 
 
 		 351 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  34.88 
 
 		 319 aa  152  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  37.04 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  30.56 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  39.27 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  38.12 
 
 		 309 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  37.84 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  32.52 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  32.52 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  32.52 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  32.52 
 
 		 317 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  29.9 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  32.48 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  35.75 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  30.46 
 
 		 345 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  32.82 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  33.08 
 
 		 290 aa  139  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  30.64 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  30.3 
 
 		 330 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  35.37 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  30.3 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  34.38 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  30.67 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  35.04 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  34.33 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  35.04 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  35.04 
 
 		 322 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  32.4 
 
 		 335 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  35.43 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  29.66 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  32.03 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  29.59 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  31.18 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  33.48 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  35.32 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  29.97 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  31.42 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  30.23 
 
 		 292 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  34.6 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  27.39 
 
 		 331 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  30.8 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  30.74 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  31.72 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  30.34 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  31.43 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  31.56 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  26.32 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  30.99 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  30.2 
 
 		 328 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  29.47 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  28.21 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  29.39 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  28.26 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  31.9 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.73 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  33.08 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  29.13 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  27.17 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.49 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  27.64 
 
 		 340 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  27.99 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  30.74 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  28.47 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  31.48 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1384  hypothetical protein  29.6 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1005  protein of unknown function DUF58  29.6 
 
 		 322 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  24.13 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  27.04 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  29.46 
 
 		 357 aa  92  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  27.92 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  26.96 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  31.31 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  27.82 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  27.46 
 
 		 294 aa  90.1  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  30 
 
 		 302 aa  89.4  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  29.36 
 
 		 350 aa  89.4  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  27.6 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.22 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  29.81 
 
 		 311 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 		 319 aa  86.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>