More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2532 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  100 
 
 		 162 aa  329  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  71.6 
 
 		 162 aa  249  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  50.66 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  51.97 
 
 		 180 aa  154  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  54.72 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  52.2 
 
 		 167 aa  152  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  48.1 
 
 		 188 aa  151  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  53.61 
 
 		 227 aa  150  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  49.03 
 
 		 182 aa  150  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  49.1 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  50.64 
 
 		 204 aa  147  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  48.21 
 
 		 185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  47.1 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  45.57 
 
 		 186 aa  144  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  48.99 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  47.1 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  49.08 
 
 		 182 aa  143  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  50.32 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  50.64 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  44.3 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  50.61 
 
 		 213 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  45.39 
 
 		 183 aa  138  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  48.08 
 
 		 183 aa  137  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  46.45 
 
 		 181 aa  137  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  46.45 
 
 		 181 aa  137  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  48.45 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  44.81 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  45.45 
 
 		 164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  47.27 
 
 		 195 aa  134  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  43.67 
 
 		 184 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  43.87 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  47.83 
 
 		 221 aa  131  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  46 
 
 		 185 aa  130  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  53.19 
 
 		 219 aa  131  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  43.23 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  43.04 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  41.46 
 
 		 201 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  46.05 
 
 		 170 aa  127  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  46.05 
 
 		 170 aa  127  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  41.61 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  43.62 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  41.12 
 
 		 230 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  43.79 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  41.46 
 
 		 201 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  42.95 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  45.29 
 
 		 200 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  48.12 
 
 		 178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  41.46 
 
 		 201 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  46.45 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  44.37 
 
 		 187 aa  125  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  46.84 
 
 		 190 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  44.65 
 
 		 178 aa  124  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  45.45 
 
 		 185 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  45.45 
 
 		 185 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  44.23 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  40.51 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  46.15 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  46.45 
 
 		 168 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  48.63 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  46.45 
 
 		 168 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  42.95 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  40.38 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  45.78 
 
 		 225 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  42.77 
 
 		 170 aa  122  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  39.87 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  41.67 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  45.45 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  45.39 
 
 		 168 aa  121  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  41.56 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  39.87 
 
 		 169 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  43.48 
 
 		 230 aa  121  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  41.77 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  41.83 
 
 		 178 aa  121  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  43.79 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  44.81 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  45.81 
 
 		 168 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  41.22 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  44.08 
 
 		 168 aa  120  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  44.12 
 
 		 190 aa  120  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  40.51 
 
 		 170 aa  120  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  40.51 
 
 		 170 aa  120  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  40.51 
 
 		 170 aa  120  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  44.08 
 
 		 168 aa  120  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  42.68 
 
 		 190 aa  120  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  42.76 
 
 		 187 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  43.42 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  42.76 
 
 		 187 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>