More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1426 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
1057 aa  2090    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  55.46 
 
 
744 aa  734    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  56.5 
 
 
739 aa  745    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  55.73 
 
 
737 aa  710    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  66.71 
 
 
759 aa  880    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.52 
 
 
736 aa  689    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  49.93 
 
 
773 aa  647    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  47.34 
 
 
801 aa  554  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.38 
 
 
747 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  46.38 
 
 
892 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  47.1 
 
 
820 aa  536  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  45.64 
 
 
789 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  41.53 
 
 
807 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  40.34 
 
 
740 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  41.12 
 
 
819 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  40.86 
 
 
880 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  41.39 
 
 
871 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  40.72 
 
 
877 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  37.75 
 
 
833 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  39.91 
 
 
821 aa  399  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  37.79 
 
 
784 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  38.14 
 
 
765 aa  381  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  37.01 
 
 
727 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  38.42 
 
 
807 aa  371  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.53 
 
 
763 aa  372  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 
758 aa  369  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  35.69 
 
 
766 aa  363  8e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  38.45 
 
 
758 aa  361  5e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  39.75 
 
 
726 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  36.65 
 
 
723 aa  359  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 
705 aa  358  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  34.69 
 
 
772 aa  357  5.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  35.68 
 
 
771 aa  355  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  37.84 
 
 
838 aa  345  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.1 
 
 
727 aa  338  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  34.83 
 
 
721 aa  333  7.000000000000001e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  34.56 
 
 
710 aa  330  9e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.49 
 
 
766 aa  330  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  33.33 
 
 
768 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  35.69 
 
 
814 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
710 aa  328  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.02 
 
 
821 aa  326  1e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.97 
 
 
695 aa  325  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 
801 aa  318  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 
808 aa  317  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.03 
 
 
817 aa  309  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 
703 aa  300  9e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  36.51 
 
 
680 aa  297  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  34.93 
 
 
761 aa  295  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  39.49 
 
 
700 aa  294  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  31.37 
 
 
773 aa  291  5.0000000000000004e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.17 
 
 
840 aa  290  9e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  33.53 
 
 
643 aa  288  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  35.66 
 
 
722 aa  288  5e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  33.28 
 
 
643 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  33.28 
 
 
643 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  33.17 
 
 
811 aa  285  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.43 
 
 
648 aa  283  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  30.77 
 
 
830 aa  279  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  35.09 
 
 
712 aa  278  5e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 
723 aa  271  4e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  33.28 
 
 
710 aa  271  7e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  32.81 
 
 
661 aa  270  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  33.38 
 
 
905 aa  269  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  33.44 
 
 
618 aa  268  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
831 aa  267  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
831 aa  267  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
830 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 
828 aa  265  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  33.59 
 
 
693 aa  265  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  32.59 
 
 
654 aa  263  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  32.36 
 
 
824 aa  263  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  32.5 
 
 
640 aa  260  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  31.74 
 
 
824 aa  260  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  31.84 
 
 
824 aa  259  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  31.27 
 
 
806 aa  259  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.88 
 
 
720 aa  259  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
816 aa  258  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
816 aa  258  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  33.84 
 
 
750 aa  258  5e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
816 aa  258  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.6 
 
 
1129 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  33.99 
 
 
776 aa  256  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
1245 aa  256  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  32.98 
 
 
719 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  35.03 
 
 
710 aa  255  3e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  30.12 
 
 
794 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
1065 aa  253  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  31.16 
 
 
649 aa  253  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.76 
 
 
761 aa  253  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
818 aa  253  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  33.56 
 
 
751 aa  251  5e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1108  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 
678 aa  251  5e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  31.63 
 
 
828 aa  249  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  31.14 
 
 
727 aa  248  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
695 aa  248  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  31.31 
 
 
810 aa  248  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  31.19 
 
 
1306 aa  247  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  37.04 
 
 
709 aa  246  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  31.76 
 
 
683 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>