65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0357 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  100 
 
 		 467 aa  912    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  53.55 
 
 		 467 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  51.19 
 
 		 470 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  50.43 
 
 		 471 aa  441  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  50.78 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  50.33 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  50.78 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  53.49 
 
 		 475 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  42.93 
 
 		 436 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  42.71 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  44.2 
 
 		 438 aa  236  6e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  28.89 
 
 		 781 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  26.93 
 
 		 737 aa  98.2  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  32.59 
 
 		 540 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  27.16 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  23.04 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  28.06 
 
 		 496 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  23.35 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  25.36 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  25.86 
 
 		 532 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  24.1 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  28.25 
 
 		 754 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 459 aa  56.6  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  35.9 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  26.73 
 
 		 497 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  28.25 
 
 		 504 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  24.8 
 
 		 474 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  23.27 
 
 		 438 aa  53.5  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  29.52 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  28.5 
 
 		 466 aa  50.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  25.96 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  25.96 
 
 		 404 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  25.96 
 
 		 404 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  30.32 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  28.9 
 
 		 594 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  24.47 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  26.29 
 
 		 425 aa  47.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 870 aa  47.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3180  O-antigen polymerase  30 
 
 		 498 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  25.96 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  27.57 
 
 		 503 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3905  O-antigen polymerase  35.51 
 
 		 456 aa  47  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3002  hypothetical protein  29.17 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0634  O-antigen polymerase  28.79 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.60095 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2436  O-antigen polymerase  37.8 
 
 		 894 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  24.17 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1186  Tetratricopeptide domain protein  27.67 
 
 		 829 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0301041  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  24 
 
 		 773 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  27.06 
 
 		 436 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2523  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 738 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0830151  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  29.02 
 
 		 494 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 582 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  23.36 
 
 		 431 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  20.25 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  22.29 
 
 		 454 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2975  O-antigen polymerase  27.16 
 
 		 549 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.024758  decreased coverage  0.00000748304 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  26.6 
 
 		 410 aa  44.3  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  27.58 
 
 		 443 aa  44.3  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  26.34 
 
 		 428 aa  44.3  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  25.4 
 
 		 498 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  23.91 
 
 		 393 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  32.26 
 
 		 503 aa  43.5  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  30.3 
 
 		 454 aa  43.5  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  32.17 
 
 		 556 aa  43.5  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2333  O-antigen polymerase  23.24 
 
 		 431 aa  43.1  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>