181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0032 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  622  1e-177  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  66.89 
 
 
317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  53.27 
 
 
306 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  50.17 
 
 
302 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  49.67 
 
 
298 aa  305  7e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  49.01 
 
 
298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  46.39 
 
 
293 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  45.7 
 
 
292 aa  282  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  46.24 
 
 
292 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  46.76 
 
 
292 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  50.18 
 
 
288 aa  250  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.49 
 
 
287 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.34 
 
 
291 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  42.81 
 
 
308 aa  202  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.27 
 
 
286 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.04 
 
 
283 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.72 
 
 
293 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.56 
 
 
301 aa  192  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.65 
 
 
279 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.98 
 
 
291 aa  188  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.65 
 
 
279 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.62 
 
 
288 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  39.3 
 
 
279 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.01 
 
 
287 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  38.61 
 
 
289 aa  185  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  37.5 
 
 
298 aa  185  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  37.41 
 
 
289 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  37.41 
 
 
289 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.42 
 
 
291 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.43 
 
 
287 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.95 
 
 
282 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.96 
 
 
294 aa  175  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  36.86 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  36.36 
 
 
289 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.25 
 
 
289 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.4 
 
 
282 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.28 
 
 
289 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  37.91 
 
 
268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.46 
 
 
290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  36.03 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.85 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.52 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  35.34 
 
 
273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  35.31 
 
 
272 aa  161  1e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  45.6 
 
 
291 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.04 
 
 
291 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  35.74 
 
 
283 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.21 
 
 
260 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.25 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  35.42 
 
 
289 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  31.38 
 
 
313 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
291 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
291 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.43 
 
 
289 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 
292 aa  102  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
318 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 
318 aa  99.4  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.07 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.5 
 
 
327 aa  95.9  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  36.65 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
301 aa  89  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.54 
 
 
301 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2196  hypothetical protein  28.76 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  34.65 
 
 
282 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
281 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2224  hypothetical protein  27.67 
 
 
280 aa  86.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
313 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.2 
 
 
296 aa  85.9  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
299 aa  85.9  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 
291 aa  85.5  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1765  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
309 aa  79  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.51 
 
 
285 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.93 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.16 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  30.69 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  30.05 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  30.16 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151892  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41088  predicted protein  29.66 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.309401  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.08 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>