232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4793 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  54.27 
 
 		 877 aa  859    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  52.51 
 
 		 739 aa  659    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  100 
 
 		 872 aa  1692    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  37.07 
 
 		 881 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  40.49 
 
 		 872 aa  547  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  45.81 
 
 		 864 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  39.88 
 
 		 880 aa  535  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  39.88 
 
 		 880 aa  532  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  45.43 
 
 		 844 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  43.44 
 
 		 855 aa  525  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  45.43 
 
 		 844 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  36.89 
 
 		 850 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  36.65 
 
 		 850 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  36.65 
 
 		 870 aa  505  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  39.02 
 
 		 880 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  39.93 
 
 		 869 aa  502  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  36.42 
 
 		 850 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  40.1 
 
 		 883 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  37.69 
 
 		 880 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  37.44 
 
 		 863 aa  490  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  40.51 
 
 		 866 aa  489  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  37.09 
 
 		 863 aa  482  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  38.46 
 
 		 880 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  36.12 
 
 		 867 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  36.32 
 
 		 867 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  38.77 
 
 		 880 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  38.65 
 
 		 880 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  38.88 
 
 		 877 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  40.1 
 
 		 854 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  38.88 
 
 		 877 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  38.65 
 
 		 880 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  38.22 
 
 		 879 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  36.73 
 
 		 854 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  35.35 
 
 		 871 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  36.31 
 
 		 875 aa  465  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  35.23 
 
 		 871 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  35.22 
 
 		 850 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  35.38 
 
 		 850 aa  459  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  35.06 
 
 		 850 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  35.46 
 
 		 850 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  35.77 
 
 		 864 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  36.21 
 
 		 850 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  40.81 
 
 		 881 aa  436  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  40.51 
 
 		 881 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  35.77 
 
 		 864 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  34.85 
 
 		 864 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  31.13 
 
 		 813 aa  418  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  34.39 
 
 		 864 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  34.35 
 
 		 889 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  38.8 
 
 		 876 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  34.35 
 
 		 889 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  34.35 
 
 		 889 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  35.39 
 
 		 864 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  35.27 
 
 		 864 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  35.66 
 
 		 896 aa  395  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  37.66 
 
 		 850 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  39.49 
 
 		 557 aa  336  9e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  28.91 
 
 		 861 aa  275  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  29.12 
 
 		 859 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  28.35 
 
 		 861 aa  274  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  31.87 
 
 		 859 aa  274  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  31.56 
 
 		 861 aa  273  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  31.56 
 
 		 861 aa  272  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  31.56 
 
 		 861 aa  272  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  31.56 
 
 		 861 aa  271  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  31.41 
 
 		 861 aa  271  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  31.41 
 
 		 861 aa  270  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  30.99 
 
 		 858 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  42.64 
 
 		 346 aa  266  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  41.79 
 
 		 429 aa  261  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  26.47 
 
 		 851 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  26.73 
 
 		 851 aa  252  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  28.29 
 
 		 569 aa  243  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  25.94 
 
 		 851 aa  233  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  36.36 
 
 		 584 aa  221  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  27.5 
 
 		 844 aa  210  8e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  35.12 
 
 		 861 aa  207  8e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  33.33 
 
 		 516 aa  205  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  24.91 
 
 		 847 aa  204  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  31.54 
 
 		 556 aa  201  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  31.54 
 
 		 556 aa  201  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  31.15 
 
 		 556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  25.2 
 
 		 840 aa  194  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  25.2 
 
 		 840 aa  194  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  31.75 
 
 		 395 aa  190  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  31.1 
 
 		 840 aa  185  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  34.24 
 
 		 568 aa  182  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  38.72 
 
 		 368 aa  181  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1469  hypothetical protein  37.66 
 
 		 368 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0291454  normal  0.344342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  39.46 
 
 		 393 aa  181  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  34.36 
 
 		 590 aa  179  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0756  hypothetical protein  37.58 
 
 		 351 aa  177  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  25.39 
 
 		 875 aa  177  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0774  hypothetical protein  38.26 
 
 		 344 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551414  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0886  hypothetical protein  38.15 
 
 		 344 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0184  hypothetical protein  38.36 
 
 		 360 aa  177  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4925  hypothetical protein  35.47 
 
 		 344 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  37.41 
 
 		 356 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  29.42 
 
 		 517 aa  171  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1656  hypothetical protein  37.95 
 
 		 353 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0333336  normal  0.970819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>