More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30110 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  100 
 
 		 469 aa  931    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1909  Amidase  76.24 
 
 		 471 aa  660    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.769881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  57.3 
 
 		 471 aa  478  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  58.24 
 
 		 504 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  54.78 
 
 		 470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  51.21 
 
 		 469 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  50.99 
 
 		 469 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  50.77 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2561  amidotransferase (amidase)  50.87 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  45.01 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4085  Amidase  53.66 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  47.26 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3159  amidase  49.45 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  43.58 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  46.76 
 
 		 478 aa  333  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  41.92 
 
 		 483 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0218  Amidase  47.37 
 
 		 469 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0507638  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3137  amidase  44.18 
 
 		 491 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  41.79 
 
 		 474 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  41.41 
 
 		 467 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  39.96 
 
 		 475 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  40.17 
 
 		 467 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  38.49 
 
 		 468 aa  279  9e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  42.42 
 
 		 473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  41.81 
 
 		 474 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  39.66 
 
 		 469 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  40.77 
 
 		 471 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  38.85 
 
 		 477 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3815  amidase  40.43 
 
 		 471 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000420509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  41.38 
 
 		 475 aa  263  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0436  putative amidase  42.36 
 
 		 471 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258075  normal  0.851149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3371  amidase  39.65 
 
 		 469 aa  256  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  38.63 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  40.65 
 
 		 458 aa  252  8.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  36.87 
 
 		 472 aa  247  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2205  amidase  40.55 
 
 		 484 aa  243  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  35.68 
 
 		 480 aa  242  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2125  amidase  36.3 
 
 		 471 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4356  amidase  37.23 
 
 		 472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0637971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  35.7 
 
 		 486 aa  233  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  36.66 
 
 		 475 aa  233  8.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5442  amidase  38.28 
 
 		 493 aa  230  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  39.27 
 
 		 463 aa  229  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  36.06 
 
 		 482 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  35.97 
 
 		 494 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  35.82 
 
 		 473 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  35.55 
 
 		 494 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0140  amidase  37.22 
 
 		 468 aa  227  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1969  amidase  38 
 
 		 470 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  37.39 
 
 		 466 aa  226  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  37.61 
 
 		 495 aa  225  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1403  amidase  36.18 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  36.03 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  34.2 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  37.08 
 
 		 475 aa  225  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0886  amidase  38.63 
 
 		 467 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0815  amidase  38.41 
 
 		 467 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3296  amidase  35.65 
 
 		 471 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297102  normal  0.0238145 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1257  amidase  35.96 
 
 		 464 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1265  amidase  35.96 
 
 		 464 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5648  amidase  36.86 
 
 		 464 aa  222  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  34.9 
 
 		 494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  39.96 
 
 		 477 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  35.29 
 
 		 485 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  34.24 
 
 		 494 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  34.24 
 
 		 494 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  34.24 
 
 		 494 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.91 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  34.77 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  34.58 
 
 		 477 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4805  amidase  36.34 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1864  amidase  35.53 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1098  amidase  35.53 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  35.48 
 
 		 499 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3929  amidase  36.01 
 
 		 471 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0454  amidase  38.67 
 
 		 471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5261  amidase  36.52 
 
 		 473 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503893  normal  0.344204 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1293  amidase  35.65 
 
 		 461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.66959  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4488  amidase  34.64 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  35.1 
 
 		 496 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  35.57 
 
 		 473 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.85 
 
 		 484 aa  210  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1032  amidase  35.09 
 
 		 464 aa  209  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.69 
 
 		 485 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  34.04 
 
 		 494 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  34.58 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  35.16 
 
 		 477 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.79 
 
 		 486 aa  207  4e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  36.05 
 
 		 492 aa  206  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  34.62 
 
 		 490 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1360  amidase  36.7 
 
 		 466 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  30.36 
 
 		 486 aa  205  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  35.16 
 
 		 549 aa  205  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55200  amidase  36.54 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772002  hitchhiker  0.00000000118324 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0381  amidase  35.31 
 
 		 464 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563141  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  34.64 
 
 		 509 aa  203  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0768  amidase  35.31 
 
 		 464 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  35.18 
 
 		 459 aa  202  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0671  Amidase  36.89 
 
 		 503 aa  200  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.378102  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  33.55 
 
 		 491 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>