More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3137 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3137  amidase  100 
 
 		 491 aa  983    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  44.18 
 
 		 469 aa  330  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  43.86 
 
 		 469 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  44.08 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  43.42 
 
 		 469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  39.25 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  41.61 
 
 		 471 aa  306  6e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  41.85 
 
 		 471 aa  300  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  44.03 
 
 		 504 aa  297  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1909  Amidase  42.54 
 
 		 471 aa  279  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.769881 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  41.63 
 
 		 478 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3159  amidase  43.52 
 
 		 469 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  39.44 
 
 		 474 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  39.87 
 
 		 470 aa  268  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4085  Amidase  41.65 
 
 		 469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  41.48 
 
 		 468 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0218  Amidase  43.68 
 
 		 469 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0507638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2561  amidotransferase (amidase)  41.63 
 
 		 477 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0436  putative amidase  38.95 
 
 		 471 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258075  normal  0.851149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  36.97 
 
 		 467 aa  239  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  38.82 
 
 		 474 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  38.84 
 
 		 475 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  38.12 
 
 		 486 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  35.21 
 
 		 475 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3815  amidase  37.15 
 
 		 471 aa  220  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000420509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  35.14 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  35.7 
 
 		 468 aa  217  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  37.67 
 
 		 471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  36.95 
 
 		 469 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5442  amidase  38.53 
 
 		 493 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  35.19 
 
 		 492 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  37.95 
 
 		 458 aa  206  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4805  amidase  36.29 
 
 		 464 aa  206  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345953  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1969  amidase  37.47 
 
 		 470 aa  206  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3371  amidase  37.83 
 
 		 469 aa  205  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  34.1 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  34.06 
 
 		 483 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2205  amidase  36.25 
 
 		 484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  32.9 
 
 		 470 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  34.13 
 
 		 507 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4356  amidase  35.97 
 
 		 472 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0637971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  32.69 
 
 		 470 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  33.69 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  32.14 
 
 		 477 aa  191  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1293  amidase  34.91 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.66959  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  35.07 
 
 		 495 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  32.97 
 
 		 507 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0454  amidase  37.98 
 
 		 471 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0140  amidase  36.23 
 
 		 468 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2125  amidase  34.23 
 
 		 471 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0886  amidase  36.4 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0815  amidase  37.13 
 
 		 467 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55200  amidase  34.35 
 
 		 464 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772002  hitchhiker  0.00000000118324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  34.7 
 
 		 473 aa  180  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3929  amidase  35.56 
 
 		 471 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1403  amidase  36.67 
 
 		 464 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1265  amidase  36.67 
 
 		 464 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1257  amidase  36.67 
 
 		 464 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  32.64 
 
 		 466 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4488  amidase  33.7 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2842  amidase  33.69 
 
 		 477 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.779137 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.75 
 
 		 491 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3526  amidase  33.26 
 
 		 490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  34.84 
 
 		 463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  32.2 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1864  amidase  36.25 
 
 		 464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1098  amidase  36.25 
 
 		 464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1032  amidase  35.27 
 
 		 464 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3296  amidase  34.33 
 
 		 471 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297102  normal  0.0238145 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3170  amidase  33.05 
 
 		 490 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.43381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  34.19 
 
 		 463 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5261  amidase  34.03 
 
 		 473 aa  172  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503893  normal  0.344204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  34.38 
 
 		 459 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  33.19 
 
 		 535 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  33.06 
 
 		 480 aa  169  9e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  31.07 
 
 		 516 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  31.07 
 
 		 516 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0903  amidase  32.91 
 
 		 469 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00690645  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  36.11 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  32.77 
 
 		 494 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  34.48 
 
 		 463 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  30.83 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  32.35 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5648  amidase  32.11 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  32.35 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  32.35 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.41 
 
 		 485 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0381  amidase  35.76 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0768  amidase  35.76 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  31.5 
 
 		 494 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.04 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  27.61 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  29.23 
 
 		 495 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  32.35 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  32.06 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  31.34 
 
 		 509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02330  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.14 
 
 		 477 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.313614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.65 
 
 		 486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3208  amidase  31.45 
 
 		 462 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.18 
 
 		 485 aa  156  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>