More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1098 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1257  amidase  99.57 
 
 
464 aa  917    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61145  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1864  amidase  100 
 
 
464 aa  922    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1098  amidase  100 
 
 
464 aa  922    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1403  amidase  99.14 
 
 
464 aa  912    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1032  amidase  92.67 
 
 
464 aa  804    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1265  amidase  99.57 
 
 
464 aa  917    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0381  amidase  99.78 
 
 
464 aa  919    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0768  amidase  99.78 
 
 
464 aa  919    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4805  amidase  65.01 
 
 
464 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55200  amidase  64.36 
 
 
464 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772002  hitchhiker  0.00000000118324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4488  amidase  62.23 
 
 
463 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5648  amidase  59.7 
 
 
464 aa  528  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1293  amidase  55.22 
 
 
461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.66959  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2125  amidase  52.27 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.543221  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5261  amidase  55.82 
 
 
473 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503893  normal  0.344204 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3929  amidase  53.56 
 
 
471 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3296  amidase  54.15 
 
 
471 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297102  normal  0.0238145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0140  amidase  55.15 
 
 
468 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202904  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5442  amidase  52.92 
 
 
493 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0454  amidase  54.42 
 
 
471 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4356  amidase  52.7 
 
 
472 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0637971  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0886  amidase  54.08 
 
 
467 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0815  amidase  53.86 
 
 
467 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1643  amidase  55.08 
 
 
463 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0396025  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1969  amidase  46 
 
 
470 aa  316  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  38.08 
 
 
469 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  37.86 
 
 
469 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  37.64 
 
 
469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2561  amidotransferase (amidase)  39.69 
 
 
477 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  38.58 
 
 
468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  35.53 
 
 
469 aa  229  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  36.29 
 
 
474 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  36.48 
 
 
470 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  38.34 
 
 
467 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  37.83 
 
 
504 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  35.9 
 
 
471 aa  217  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3159  amidase  37.19 
 
 
469 aa  216  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  36.79 
 
 
473 aa  216  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3815  amidase  36.4 
 
 
471 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000420509  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  33.62 
 
 
471 aa  206  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  35.58 
 
 
475 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0218  Amidase  37.86 
 
 
469 aa  206  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0507638  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  34.42 
 
 
475 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  33.41 
 
 
472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1909  Amidase  35.08 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.769881 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  35.21 
 
 
474 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0436  putative amidase  35.48 
 
 
471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258075  normal  0.851149 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.17 
 
 
485 aa  197  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  32.65 
 
 
477 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  37.99 
 
 
478 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  32.17 
 
 
468 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  32.44 
 
 
472 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  33.82 
 
 
471 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3137  amidase  36.46 
 
 
491 aa  190  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26516 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  33.33 
 
 
494 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  33.97 
 
 
487 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  34.67 
 
 
461 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  34.81 
 
 
490 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  33.9 
 
 
458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  32.86 
 
 
494 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  32.17 
 
 
472 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  32.3 
 
 
494 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  33.7 
 
 
483 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  34.75 
 
 
459 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  32.32 
 
 
494 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4085  Amidase  35.18 
 
 
469 aa  180  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  34.58 
 
 
490 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  34.6 
 
 
463 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4324  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.09 
 
 
485 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000269124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0559  amidase  36.44 
 
 
468 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  32.08 
 
 
494 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  32.08 
 
 
494 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  32.08 
 
 
494 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  33.92 
 
 
477 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3170  amidase  32.99 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.43381 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3526  amidase  32.99 
 
 
490 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  32.5 
 
 
496 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1935  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.82 
 
 
486 aa  173  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186595  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.11 
 
 
486 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  33.33 
 
 
486 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3747  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.24 
 
 
486 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.814256  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.13 
 
 
483 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0682  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.12 
 
 
485 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2842  amidase  32.85 
 
 
477 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.779137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  33.05 
 
 
461 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  32.21 
 
 
485 aa  171  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3751  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.22 
 
 
485 aa  171  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.76 
 
 
484 aa  170  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  32.77 
 
 
481 aa  170  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  33.84 
 
 
473 aa  169  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.95 
 
 
485 aa  169  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0075  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.77 
 
 
485 aa  169  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.281052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  34.73 
 
 
469 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15821  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.35 
 
 
486 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.69 
 
 
491 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.15 
 
 
485 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  33.76 
 
 
463 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  33.26 
 
 
468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  27.52 
 
 
486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2615  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.86 
 
 
482 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>