More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5648 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5648  amidase  100 
 
 		 464 aa  942    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4488  amidase  75.98 
 
 		 463 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4805  amidase  58.01 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55200  amidase  59.31 
 
 		 464 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772002  hitchhiker  0.00000000118324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3296  amidase  59.31 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297102  normal  0.0238145 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1864  amidase  59.27 
 
 		 464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1403  amidase  59.27 
 
 		 464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1032  amidase  58.62 
 
 		 464 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1098  amidase  59.27 
 
 		 464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1257  amidase  59.48 
 
 		 464 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1265  amidase  59.48 
 
 		 464 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1293  amidase  57.52 
 
 		 461 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.66959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0381  amidase  59.05 
 
 		 464 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0768  amidase  59.05 
 
 		 464 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2125  amidase  55.19 
 
 		 471 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3929  amidase  56.93 
 
 		 471 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5261  amidase  58.32 
 
 		 473 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503893  normal  0.344204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4356  amidase  58.41 
 
 		 472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0637971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0454  amidase  56.19 
 
 		 471 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1643  amidase  54.98 
 
 		 463 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0396025  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0886  amidase  56.99 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0140  amidase  54.72 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0815  amidase  56.56 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5442  amidase  51.41 
 
 		 493 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1969  amidase  49.67 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  38.33 
 
 		 469 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  38.11 
 
 		 469 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  39.08 
 
 		 469 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  36.56 
 
 		 468 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  37.08 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2561  amidotransferase (amidase)  38.46 
 
 		 477 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  36.91 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  38.06 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  37.15 
 
 		 474 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  35.24 
 
 		 471 aa  224  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  33.62 
 
 		 471 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  34.42 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  37.14 
 
 		 504 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3159  amidase  36.26 
 
 		 469 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3815  amidase  33.48 
 
 		 471 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000420509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  31.36 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0218  Amidase  35.82 
 
 		 469 aa  192  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0507638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  34.46 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.28 
 
 		 485 aa  189  7e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1909  Amidase  33.33 
 
 		 471 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.769881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  32.2 
 
 		 461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  32.59 
 
 		 472 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  32.64 
 
 		 486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  32.13 
 
 		 471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  32.05 
 
 		 475 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  32.14 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  32 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  35 
 
 		 469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0436  putative amidase  31.95 
 
 		 471 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258075  normal  0.851149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4085  Amidase  33.4 
 
 		 469 aa  179  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.69 
 
 		 491 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.48 
 
 		 505 aa  179  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  34.81 
 
 		 478 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  33.12 
 
 		 458 aa  176  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.58 
 
 		 486 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  31.85 
 
 		 487 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3137  amidase  31.89 
 
 		 491 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.39 
 
 		 485 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2368  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  31.98 
 
 		 496 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  31.4 
 
 		 475 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09121  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.79 
 
 		 482 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  31.22 
 
 		 496 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09141  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.3 
 
 		 482 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  30.77 
 
 		 477 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.32 
 
 		 488 aa  169  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.97 
 
 		 486 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3170  amidase  32.92 
 
 		 490 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.43381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  29.88 
 
 		 475 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02330  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.1 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.313614  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  31.03 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2842  amidase  32.76 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.779137 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3751  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.24 
 
 		 485 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.65 
 
 		 486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  29.65 
 
 		 486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  31.19 
 
 		 468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0418  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.51 
 
 		 499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3371  amidase  34.78 
 
 		 469 aa  167  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3526  amidase  32.92 
 
 		 490 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.51 
 
 		 487 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  29.81 
 
 		 483 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2360  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.26 
 
 		 487 aa  167  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.100992  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  30.19 
 
 		 494 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.89 
 
 		 486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.51 
 
 		 486 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  32.15 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.03 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  31.26 
 
 		 475 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.45 
 
 		 494 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10291  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.78 
 
 		 484 aa  163  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.484565  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.93 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.61 
 
 		 485 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.47 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.25 
 
 		 491 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4324  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.44 
 
 		 485 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000269124  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.59 
 
 		 482 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>