More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1257 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1265  amidase  100 
 
 		 464 aa  922    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1864  amidase  99.57 
 
 		 464 aa  917    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1098  amidase  99.57 
 
 		 464 aa  917    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1403  amidase  99.57 
 
 		 464 aa  917    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0381  amidase  99.35 
 
 		 464 aa  913    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563141  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1032  amidase  93.1 
 
 		 464 aa  808    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0768  amidase  99.35 
 
 		 464 aa  913    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1257  amidase  100 
 
 		 464 aa  922    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61145  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4805  amidase  65.44 
 
 		 464 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55200  amidase  64.79 
 
 		 464 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772002  hitchhiker  0.00000000118324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4488  amidase  62.45 
 
 		 463 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5648  amidase  59.91 
 
 		 464 aa  529  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1293  amidase  55.65 
 
 		 461 aa  458  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.66959  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2125  amidase  52.48 
 
 		 471 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5261  amidase  56.25 
 
 		 473 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503893  normal  0.344204 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3929  amidase  53.78 
 
 		 471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3296  amidase  54.37 
 
 		 471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297102  normal  0.0238145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0140  amidase  55.58 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5442  amidase  53.13 
 
 		 493 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0454  amidase  54.65 
 
 		 471 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4356  amidase  52.92 
 
 		 472 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0637971  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0815  amidase  54.29 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0886  amidase  54.51 
 
 		 467 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1643  amidase  55.29 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0396025  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1969  amidase  46.64 
 
 		 470 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  38.53 
 
 		 469 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  38.31 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  38.08 
 
 		 469 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2561  amidotransferase (amidase)  40.13 
 
 		 477 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  39.01 
 
 		 468 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  35.96 
 
 		 469 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  36.5 
 
 		 474 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  36.92 
 
 		 470 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  36.34 
 
 		 471 aa  222  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  38.26 
 
 		 504 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3159  amidase  37.64 
 
 		 469 aa  221  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3815  amidase  36.83 
 
 		 471 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000420509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  38.34 
 
 		 467 aa  221  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  37 
 
 		 473 aa  216  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  36 
 
 		 475 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  33.83 
 
 		 471 aa  211  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0218  Amidase  38.31 
 
 		 469 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0507638  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  34.83 
 
 		 475 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1909  Amidase  35.51 
 
 		 471 aa  206  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.769881 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0436  putative amidase  35.91 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258075  normal  0.851149 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  35.42 
 
 		 474 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  33.33 
 
 		 472 aa  202  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  32.61 
 
 		 468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  32.85 
 
 		 477 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.17 
 
 		 485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  38.21 
 
 		 478 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  34.03 
 
 		 471 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3137  amidase  36.89 
 
 		 491 aa  196  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  32.57 
 
 		 472 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  34.18 
 
 		 487 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  33.33 
 
 		 494 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  34.89 
 
 		 461 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  34.11 
 
 		 458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4085  Amidase  35.39 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  34.81 
 
 		 490 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  32.86 
 
 		 494 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  34.97 
 
 		 459 aa  183  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  32.17 
 
 		 472 aa  182  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  34.81 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  32.3 
 
 		 494 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  33.85 
 
 		 483 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4324  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.3 
 
 		 485 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000269124  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  32.32 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  34.58 
 
 		 490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0559  amidase  36.65 
 
 		 468 aa  179  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  33.76 
 
 		 486 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  34.15 
 
 		 477 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  32.08 
 
 		 494 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  32.08 
 
 		 494 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3170  amidase  32.99 
 
 		 490 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.43381 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  32.08 
 
 		 494 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1935  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.02 
 
 		 486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  32.71 
 
 		 496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.31 
 
 		 486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3526  amidase  32.99 
 
 		 490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  35.16 
 
 		 469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0682  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.61 
 
 		 485 aa  174  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3747  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.44 
 
 		 486 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.814256  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.96 
 
 		 484 aa  173  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  33.68 
 
 		 468 aa  173  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3751  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.92 
 
 		 485 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  34.72 
 
 		 475 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.64 
 
 		 485 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0075  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.45 
 
 		 485 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.281052 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.45 
 
 		 483 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2842  amidase  32.85 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.779137 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.79 
 
 		 483 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  32.21 
 
 		 485 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  32.98 
 
 		 481 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  34.05 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.91 
 
 		 491 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  33.05 
 
 		 461 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.35 
 
 		 485 aa  171  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  27.71 
 
 		 486 aa  170  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2615  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.07 
 
 		 482 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>