More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21930 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.48 
 
 		 990 aa  699    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  50.26 
 
 		 994 aa  845    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.33 
 
 		 981 aa  957    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  74.6 
 
 		 996 aa  1116    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  60.46 
 
 		 916 aa  1011    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.52 
 
 		 933 aa  880    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  61.2 
 
 		 904 aa  1051    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.52 
 
 		 919 aa  979    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  57.46 
 
 		 947 aa  1039    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.42 
 
 		 950 aa  889    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  58.07 
 
 		 1026 aa  649    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.49 
 
 		 984 aa  916    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.11 
 
 		 922 aa  1044    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  59.67 
 
 		 918 aa  1008    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  58.28 
 
 		 940 aa  970    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.91 
 
 		 921 aa  944    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.41 
 
 		 917 aa  946    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.14 
 
 		 964 aa  904    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.02 
 
 		 950 aa  1000    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  59.5 
 
 		 906 aa  986    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  59.21 
 
 		 906 aa  978    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  57.17 
 
 		 936 aa  993    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.42 
 
 		 931 aa  962    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  60.83 
 
 		 909 aa  1041    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.67 
 
 		 918 aa  1008    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  100 
 
 		 918 aa  1844    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.13 
 
 		 929 aa  966    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  61.99 
 
 		 935 aa  1045    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.55 
 
 		 932 aa  932    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.18 
 
 		 951 aa  982    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  52.7 
 
 		 953 aa  889    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  55.12 
 
 		 952 aa  880    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  54.83 
 
 		 972 aa  926    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.36 
 
 		 951 aa  1018    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.56 
 
 		 918 aa  1008    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  49.67 
 
 		 877 aa  553  1e-156  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  53.05 
 
 		 863 aa  551  1e-155  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.17 
 
 		 815 aa  443  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  34.98 
 
 		 889 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  34.33 
 
 		 926 aa  409  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  34.35 
 
 		 893 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  33.76 
 
 		 924 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  32.32 
 
 		 905 aa  395  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  30.29 
 
 		 908 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.29 
 
 		 952 aa  392  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  30.08 
 
 		 908 aa  389  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  30.07 
 
 		 908 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  32.57 
 
 		 927 aa  386  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.8 
 
 		 927 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  30.18 
 
 		 967 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  30.22 
 
 		 908 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  33.71 
 
 		 924 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  32.66 
 
 		 924 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  30.29 
 
 		 967 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  30.6 
 
 		 1003 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  41.37 
 
 		 890 aa  375  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  33.8 
 
 		 919 aa  369  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  29.59 
 
 		 1068 aa  347  7e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  30.48 
 
 		 1023 aa  337  7e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  39.14 
 
 		 1055 aa  335  3e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  28.18 
 
 		 1068 aa  330  6e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  29.97 
 
 		 872 aa  330  9e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  28.68 
 
 		 1073 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  37.52 
 
 		 1239 aa  314  5.999999999999999e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  29.25 
 
 		 998 aa  311  4e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  29.39 
 
 		 1185 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  37.17 
 
 		 933 aa  293  8e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  61.04 
 
 		 961 aa  293  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  36.69 
 
 		 1175 aa  291  5.0000000000000004e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.42 
 
 		 843 aa  286  9e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.67 
 
 		 762 aa  277  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.85 
 
 		 709 aa  269  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.77 
 
 		 424 aa  177  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  45.29 
 
 		 1209 aa  176  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.01 
 
 		 817 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  28.65 
 
 		 842 aa  165  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  40.36 
 
 		 1293 aa  154  8.999999999999999e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  30.3 
 
 		 869 aa  153  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.43 
 
 		 861 aa  151  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  30.42 
 
 		 885 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  30.53 
 
 		 727 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  30.3 
 
 		 830 aa  148  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  29.88 
 
 		 799 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  30.46 
 
 		 855 aa  147  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  29.1 
 
 		 877 aa  146  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.68 
 
 		 845 aa  145  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.63 
 
 		 747 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.76 
 
 		 709 aa  141  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.34 
 
 		 700 aa  141  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.78 
 
 		 707 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  29.66 
 
 		 712 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.81 
 
 		 694 aa  137  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.7 
 
 		 747 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.46 
 
 		 751 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  27.79 
 
 		 726 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.15 
 
 		 707 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  30 
 
 		 824 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.7 
 
 		 710 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.5 
 
 		 706 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.91 
 
 		 803 aa  130  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>