144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0026 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0026  thiamine biosynthesis protein:ExsB  100 
 
 
326 aa  675    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1992  hypothetical protein  53.33 
 
 
349 aa  347  2e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1805  hypothetical protein  53.33 
 
 
327 aa  344  1e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1624  hypothetical protein  52.73 
 
 
327 aa  340  2e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.425475  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1498  hypothetical protein  51.82 
 
 
327 aa  338  7e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1979  thiamine biosynthesis protein:ExsB  50.46 
 
 
327 aa  331  1e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1609  thiamine biosynthesis protein:ExsB  51.06 
 
 
327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1746  thiamine biosynthesis protein:ExsB  48.93 
 
 
329 aa  310  2e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0801  ATP-binding protein  50.66 
 
 
324 aa  301  9e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2075  thiamine biosynthesis protein:ExsB  50.97 
 
 
329 aa  296  5e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  44.24 
 
 
329 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1299  thiamine biosynthesis protein  46.59 
 
 
355 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1163  hypothetical protein  44.19 
 
 
328 aa  253  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0384  thiamine biosynthesis protein  45.48 
 
 
351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.624695  hitchhiker  0.00868448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4045  thiamine biosynthesis protein  43.64 
 
 
351 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4188  thiamine biosynthesis protein  43.52 
 
 
351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4161  thiamine biosynthesis protein  43.52 
 
 
351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1496  protein of unknown function DUF814  40.87 
 
 
327 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2474  thiamin biosynthesis protein ThiI  42.07 
 
 
326 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2184  argininosuccinate synthase  42.07 
 
 
326 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1071  thiamine biosynthesis protein  42.28 
 
 
335 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0082  thiamine biosynthesis protein  42.62 
 
 
334 aa  232  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0065  thiamine biosynthesis protein  41.97 
 
 
334 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.96842e-23 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1061  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase / fibronectin/fibrinogen-binding protein  38.72 
 
 
329 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.391536  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1219  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  37.58 
 
 
354 aa  227  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4272  thiamine biosynthesis protein  39.41 
 
 
334 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0434  hypothetical protein  38.73 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1725  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  38.76 
 
 
337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3402  thiamine biosynthesis protein  37.96 
 
 
334 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2654  hypothetical protein  40.97 
 
 
347 aa  217  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00416391  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3145  hypothetical protein  39.87 
 
 
346 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.221645  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2769  hypothetical protein  40.88 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778027  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3219  thiamine biosynthesis protein  39.06 
 
 
333 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2797  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase  39.13 
 
 
331 aa  206  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000576654  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0405  thiamine biosynthesis protein  40.65 
 
 
345 aa  202  9e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2450  thiamine biosynthesis protein  39.35 
 
 
352 aa  191  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0309  hypothetical protein  37.46 
 
 
349 aa  183  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2372  hypothetical protein  34.59 
 
 
357 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000114865  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0875  thiamine biosynthesis protein  35.69 
 
 
368 aa  175  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.408938 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1904  thiamine biosynthesis protein  35.96 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0292  thiamine biosynthesis protein  34.58 
 
 
376 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000151674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3179  thiamine biosynthesis protein  36.13 
 
 
357 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1938  hypothetical protein  30 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.186563  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1033  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  28.23 
 
 
355 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1987  hypothetical protein  30.16 
 
 
213 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2170  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  30.09 
 
 
346 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  29.24 
 
 
387 aa  52.8  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1858  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  28.81 
 
 
352 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000793578  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1704  PP-loop domain protein  24.73 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0697664  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1602  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  26.71 
 
 
358 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1347  normal  0.338621 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0690  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29 
 
 
366 aa  50.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.253625  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2662  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  30.7 
 
 
368 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0404  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  21.43 
 
 
436 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0639717  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1750  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  28.44 
 
 
358 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0112928  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0689  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25.47 
 
 
362 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0580187  normal  0.600497 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1772  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  30 
 
 
348 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0277772  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0463  thiamine biosynthesis protein ThiI  30 
 
 
392 aa  47.8  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2900  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.2 
 
 
375 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0817  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  27.7 
 
 
382 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.866621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1841  hypothetical protein  31.19 
 
 
269 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.03 
 
 
380 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2184  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.08 
 
 
363 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.414855  normal  0.985413 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0837  ExsB family protein  25.44 
 
 
261 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265876  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1930  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  22.32 
 
 
359 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000673217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0814  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  28.95 
 
 
391 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  27.52 
 
 
404 aa  46.6  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2897  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  31.86 
 
 
347 aa  46.6  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1735  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  26.61 
 
 
383 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2905  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  22.22 
 
 
357 aa  46.6  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000328107  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21116  predicted protein  27.03 
 
 
418 aa  46.2  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  26.72 
 
 
370 aa  46.6  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2600  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.29 
 
 
398 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0779  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  26.5 
 
 
357 aa  46.2  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2136  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  28.85 
 
 
373 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  28.69 
 
 
436 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0603  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  22.54 
 
 
400 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.365689  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3596  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  19.92 
 
 
374 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_685  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  26.5 
 
 
357 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  36.51 
 
 
218 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0953  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  25.81 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1555  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  29.32 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.168737  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1067  argininosuccinate synthase  24.29 
 
 
409 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337048  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13040  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  26.67 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.4029e-26  decreased coverage  0.000450672 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  28.32 
 
 
288 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1045  argininosuccinate synthase  24.29 
 
 
409 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000136428  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0737  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyltransferase  25.96 
 
 
353 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01883  arginosuccinate synthetase (Eurofung)  30.11 
 
 
416 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2154  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  27.42 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00771219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1881  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  21.74 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  34.92 
 
 
219 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1612  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  26.61 
 
 
371 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0680  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.91 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0208  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  35.04 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.203625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2851  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  26.61 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.602222 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1869  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  27.42 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1720  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  26.61 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0088  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  22.22 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0120673 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2839  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  30 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0299  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  26.23 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0829  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.91 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0242691  normal  0.504253 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>