71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1498 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1498  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  670    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1992  hypothetical protein  83.18 
 
 		 349 aa  566  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1624  hypothetical protein  81.65 
 
 		 327 aa  558  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.425475  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1805  hypothetical protein  81.65 
 
 		 327 aa  557  1e-158  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1746  thiamine biosynthesis protein:ExsB  62.77 
 
 		 329 aa  436  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1609  thiamine biosynthesis protein:ExsB  59.33 
 
 		 327 aa  392  1e-108  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0801  ATP-binding protein  58.33 
 
 		 324 aa  393  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2075  thiamine biosynthesis protein:ExsB  57.14 
 
 		 329 aa  384  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1979  thiamine biosynthesis protein:ExsB  53.05 
 
 		 327 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0026  thiamine biosynthesis protein:ExsB  51.82 
 
 		 326 aa  338  7e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  44.81 
 
 		 329 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1496  protein of unknown function DUF814  50.19 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1163  hypothetical protein  42.02 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2654  hypothetical protein  43.53 
 
 		 347 aa  240  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00416391  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1299  thiamine biosynthesis protein  40.95 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1071  thiamine biosynthesis protein  41.5 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0434  hypothetical protein  40.2 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3219  thiamine biosynthesis protein  43.48 
 
 		 333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1219  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  40.12 
 
 		 354 aa  225  8e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0082  thiamine biosynthesis protein  41.95 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0065  thiamine biosynthesis protein  41.2 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.96842e-23 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1061  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase / fibronectin/fibrinogen-binding protein  39.22 
 
 		 329 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.391536  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4272  thiamine biosynthesis protein  41.23 
 
 		 334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3145  hypothetical protein  39.55 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.221645  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4045  thiamine biosynthesis protein  38.84 
 
 		 351 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4188  thiamine biosynthesis protein  38.53 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4161  thiamine biosynthesis protein  38.53 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0384  thiamine biosynthesis protein  38.11 
 
 		 351 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.624695  hitchhiker  0.00868448 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3402  thiamine biosynthesis protein  39.48 
 
 		 334 aa  215  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2769  hypothetical protein  40.96 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2184  argininosuccinate synthase  38.79 
 
 		 326 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0405  thiamine biosynthesis protein  43.7 
 
 		 345 aa  208  8e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2474  thiamin biosynthesis protein ThiI  38.79 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2797  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase  39.46 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000576654  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1725  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  38.82 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2372  hypothetical protein  34.24 
 
 		 357 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000114865  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2450  thiamine biosynthesis protein  36.28 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0309  hypothetical protein  35.22 
 
 		 349 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0875  thiamine biosynthesis protein  37.5 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.408938 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1904  thiamine biosynthesis protein  36.95 
 
 		 368 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0292  thiamine biosynthesis protein  34.8 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000151674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3179  thiamine biosynthesis protein  36.12 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0680  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.91 
 
 		 352 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0829  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.91 
 
 		 352 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0242691  normal  0.504253 
 
 
-
 
NC_002936  DET0779  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  29.23 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_685  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.41 
 
 		 357 aa  49.3  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0689  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  26.5 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  30 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2839  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  32 
 
 		 351 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0837  ExsB family protein  25.68 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1858  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  28.81 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000793578  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0088  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.63 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0120673 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0464  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.2 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000807441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1837  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  27.97 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0170867  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0690  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.59 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.253625  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  24.32 
 
 		 392 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6065  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.65 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0345037  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  24.88 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0851  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  25.78 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.273783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1976  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  26.83 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5063  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  24.32 
 
 		 384 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0757957 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1718  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  25 
 
 		 367 aa  43.5  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.530012  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2037  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  28 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0766  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25.4 
 
 		 367 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0406399  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1753  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  28 
 
 		 359 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0601571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0710  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  28.81 
 
 		 341 aa  43.1  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2564  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  25.95 
 
 		 362 aa  43.1  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.15702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4577  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.65 
 
 		 395 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.969326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1881  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  24.64 
 
 		 397 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  34.85 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2897  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  30.17 
 
 		 347 aa  42.4  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>