171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1613 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  100 
 
 
392 aa  788    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  49.22 
 
 
404 aa  386  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  46.75 
 
 
387 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  37.94 
 
 
436 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.17 
 
 
370 aa  220  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  38.38 
 
 
369 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.96 
 
 
361 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.6 
 
 
383 aa  209  8e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.55 
 
 
406 aa  209  8e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.24 
 
 
383 aa  209  8e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.51 
 
 
383 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0664  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.42 
 
 
385 aa  203  5e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.51 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.38 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  38.5 
 
 
502 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  38.76 
 
 
335 aa  199  5e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1771  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.12 
 
 
407 aa  193  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1806  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.12 
 
 
407 aa  193  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.25 
 
 
416 aa  191  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.34 
 
 
493 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0990  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.91 
 
 
398 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0024577  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1320  thiamine biosynthesis protein  37.38 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2307  thiamine biosynthesis protein  36.5 
 
 
395 aa  189  7e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0561858  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3460  Thiamine biosynthesis protein-like protein  35.01 
 
 
392 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.81 
 
 
400 aa  188  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1140  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.91 
 
 
385 aa  185  9e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2351  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.02 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1671  thiamine biosynthesis protein  35.26 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.63 
 
 
474 aa  182  7e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.33 
 
 
371 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.2 
 
 
422 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.48 
 
 
482 aa  179  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.882891 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.48 
 
 
482 aa  179  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.22 
 
 
482 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.48 
 
 
482 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.48 
 
 
482 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.48 
 
 
482 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.48 
 
 
482 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2718  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.41 
 
 
401 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0451  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.03 
 
 
407 aa  177  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0130  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.47 
 
 
389 aa  177  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00491755  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.48 
 
 
482 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0763  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.16 
 
 
389 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00421556  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.22 
 
 
482 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1683  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.51 
 
 
392 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.22 
 
 
482 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.22 
 
 
482 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  34.22 
 
 
482 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.22 
 
 
482 aa  177  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.22 
 
 
482 aa  177  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.45 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.661322  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.45 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  29.59 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1272  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.75 
 
 
392 aa  173  5e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000028573  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1330  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.75 
 
 
392 aa  173  5e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000522414  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1063  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.23 
 
 
392 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1372  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.21 
 
 
404 aa  172  9e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000114319  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.74 
 
 
482 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.39 
 
 
407 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.99 
 
 
482 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1223  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.73 
 
 
405 aa  170  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000164675  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.61 
 
 
390 aa  170  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1110  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.43 
 
 
376 aa  169  9e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.142781  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0890  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.21 
 
 
515 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.49206  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.24 
 
 
482 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2301  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.57 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.01 
 
 
472 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0731  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.91 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000207137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3122  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.48 
 
 
429 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.16 
 
 
482 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3319  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.16 
 
 
403 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1081  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.91 
 
 
482 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.06 
 
 
414 aa  163  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl584  thiamin biosynthesis protein  29.13 
 
 
400 aa  161  2e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.662181  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11930  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  40.86 
 
 
420 aa  160  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000175625  normal  0.0434054 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0512  thiamine biosynthesis protein  33.68 
 
 
407 aa  159  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0463  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.8 
 
 
392 aa  159  1e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.1 
 
 
483 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4478  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.43 
 
 
403 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.1 
 
 
483 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.1 
 
 
483 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4391  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.17 
 
 
404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07780  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.16 
 
 
410 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.680526 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4784  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.17 
 
 
404 aa  156  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4899  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.17 
 
 
403 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4545  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.17 
 
 
404 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4765  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.17 
 
 
404 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4381  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.91 
 
 
404 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.59 
 
 
398 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4756  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.17 
 
 
404 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4782  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.91 
 
 
404 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22060  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.3 
 
 
396 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.733648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1666  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.43 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.19 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1402  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.43 
 
 
385 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0806  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  39.45 
 
 
414 aa  153  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.305799  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0479  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.91 
 
 
404 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000040209 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.9 
 
 
500 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.87 
 
 
484 aa  149  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0239  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.39 
 
 
395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0302483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>