82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1624 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1805  hypothetical protein  99.39 
 
 
327 aa  665    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1992  hypothetical protein  96.02 
 
 
349 aa  647    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1624  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  669    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.425475  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1498  hypothetical protein  81.65 
 
 
327 aa  558  1e-158  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1746  thiamine biosynthesis protein:ExsB  59.69 
 
 
329 aa  408  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0801  ATP-binding protein  58.02 
 
 
324 aa  387  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1609  thiamine biosynthesis protein:ExsB  57.8 
 
 
327 aa  382  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2075  thiamine biosynthesis protein:ExsB  55.62 
 
 
329 aa  370  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0026  thiamine biosynthesis protein:ExsB  52.73 
 
 
326 aa  340  2e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1979  thiamine biosynthesis protein:ExsB  51.52 
 
 
327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  47.96 
 
 
329 aa  261  8e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1496  protein of unknown function DUF814  46.25 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1299  thiamine biosynthesis protein  42.61 
 
 
355 aa  249  6e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0434  hypothetical protein  44.3 
 
 
334 aa  242  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4272  thiamine biosynthesis protein  42.35 
 
 
334 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0065  thiamine biosynthesis protein  45.1 
 
 
334 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.96842e-23 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2654  hypothetical protein  42.46 
 
 
347 aa  238  8e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00416391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1071  thiamine biosynthesis protein  43.04 
 
 
335 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0082  thiamine biosynthesis protein  42.9 
 
 
334 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1163  hypothetical protein  41.02 
 
 
328 aa  233  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3402  thiamine biosynthesis protein  43.23 
 
 
334 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3145  hypothetical protein  39.45 
 
 
346 aa  226  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.221645  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2769  hypothetical protein  42.86 
 
 
325 aa  226  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778027  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1061  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase / fibronectin/fibrinogen-binding protein  41.64 
 
 
329 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.391536  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1219  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  40.87 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3219  thiamine biosynthesis protein  39.74 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4045  thiamine biosynthesis protein  40.76 
 
 
351 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0384  thiamine biosynthesis protein  41.08 
 
 
351 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.624695  hitchhiker  0.00868448 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4188  thiamine biosynthesis protein  40.45 
 
 
351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4161  thiamine biosynthesis protein  40.45 
 
 
351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2184  argininosuccinate synthase  39.88 
 
 
326 aa  215  9e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2474  thiamin biosynthesis protein ThiI  39.88 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1725  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  38.14 
 
 
337 aa  210  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0405  thiamine biosynthesis protein  45.35 
 
 
345 aa  209  5e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2797  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase  40.68 
 
 
331 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000576654  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2450  thiamine biosynthesis protein  41.89 
 
 
352 aa  189  7e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2372  hypothetical protein  39.29 
 
 
357 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000114865  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0309  hypothetical protein  34.88 
 
 
349 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1904  thiamine biosynthesis protein  39.45 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0875  thiamine biosynthesis protein  39.11 
 
 
368 aa  169  8e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.408938 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0292  thiamine biosynthesis protein  34.77 
 
 
376 aa  152  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000151674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3179  thiamine biosynthesis protein  36.1 
 
 
357 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0689  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.06 
 
 
343 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0680  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.91 
 
 
352 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0829  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.91 
 
 
352 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0242691  normal  0.504253 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1858  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.66 
 
 
352 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000793578  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0779  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  28.57 
 
 
357 aa  50.1  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_685  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  28.57 
 
 
357 aa  49.3  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0690  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  30.61 
 
 
366 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.253625  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0088  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.03 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0120673 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1718  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  26.39 
 
 
367 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.530012  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0851  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  24.6 
 
 
371 aa  46.6  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.273783  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1496  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25.36 
 
 
401 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  28.33 
 
 
335 aa  46.2  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2839  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  30 
 
 
351 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0417  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  29.91 
 
 
358 aa  45.8  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000611049  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4116  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  24.64 
 
 
402 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72585  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1058  ExsB family protein  26.96 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205582 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0401  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  28.7 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00780363  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0837  ExsB family protein  26.32 
 
 
261 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265876  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3962  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  24.64 
 
 
402 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2170  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  27.66 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1837  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  29.17 
 
 
355 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0170867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1976  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  26.83 
 
 
359 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  27.27 
 
 
436 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2244  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  26.05 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1019  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  27.5 
 
 
356 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16029  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0603  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.91 
 
 
400 aa  43.9  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.365689  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2564  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  23.26 
 
 
362 aa  43.9  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.15702  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.14 
 
 
390 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0695  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.91 
 
 
400 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6065  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  21.62 
 
 
382 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0345037  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1881  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.91 
 
 
397 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  26.67 
 
 
370 aa  43.1  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0987  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.19 
 
 
404 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.243634  decreased coverage  0.00000758773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5063  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  22.97 
 
 
384 aa  43.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0757957 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1555  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  28.03 
 
 
341 aa  43.1  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.168737  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34492  argininosuccinate synthetase  23.27 
 
 
416 aa  42.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.491384  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0705  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  26.05 
 
 
361 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  25 
 
 
392 aa  42.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0766  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  26.62 
 
 
367 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0406399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0464  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  27.43 
 
 
338 aa  42.4  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000807441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>