60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0801 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0801  ATP-binding protein  100 
 
 		 324 aa  662    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2075  thiamine biosynthesis protein:ExsB  80.86 
 
 		 329 aa  530  1e-149  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1746  thiamine biosynthesis protein:ExsB  58.77 
 
 		 329 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1498  hypothetical protein  58.33 
 
 		 327 aa  393  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1992  hypothetical protein  58.02 
 
 		 349 aa  391  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1805  hypothetical protein  58.33 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1624  hypothetical protein  58.02 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.425475  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1609  thiamine biosynthesis protein:ExsB  58.33 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1979  thiamine biosynthesis protein:ExsB  49.54 
 
 		 327 aa  333  3e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0026  thiamine biosynthesis protein:ExsB  50.66 
 
 		 326 aa  301  9e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1496  protein of unknown function DUF814  43.21 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  44.59 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1061  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase / fibronectin/fibrinogen-binding protein  43.42 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.391536  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1163  hypothetical protein  42.21 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2654  hypothetical protein  38.33 
 
 		 347 aa  225  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00416391  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4045  thiamine biosynthesis protein  42.41 
 
 		 351 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3145  hypothetical protein  40.13 
 
 		 346 aa  222  8e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.221645  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4161  thiamine biosynthesis protein  42.09 
 
 		 351 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4188  thiamine biosynthesis protein  42.09 
 
 		 351 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329777  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1219  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  39.87 
 
 		 354 aa  219  7e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1299  thiamine biosynthesis protein  44.11 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1071  thiamine biosynthesis protein  40.58 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0384  thiamine biosynthesis protein  41.25 
 
 		 351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.624695  hitchhiker  0.00868448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3219  thiamine biosynthesis protein  39.94 
 
 		 333 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0434  hypothetical protein  38.31 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3402  thiamine biosynthesis protein  39.13 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4272  thiamine biosynthesis protein  37.89 
 
 		 334 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2797  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase  38.64 
 
 		 331 aa  208  9e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000576654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2769  hypothetical protein  39.14 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2184  argininosuccinate synthase  39.48 
 
 		 326 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2474  thiamin biosynthesis protein ThiI  39.48 
 
 		 326 aa  205  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0065  thiamine biosynthesis protein  39.74 
 
 		 334 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.96842e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0082  thiamine biosynthesis protein  39.74 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1725  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  39.12 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0405  thiamine biosynthesis protein  42.26 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2450  thiamine biosynthesis protein  42.58 
 
 		 352 aa  195  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1904  thiamine biosynthesis protein  36.04 
 
 		 368 aa  175  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2372  hypothetical protein  39.27 
 
 		 357 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000114865  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0309  hypothetical protein  38.43 
 
 		 349 aa  169  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0875  thiamine biosynthesis protein  33.64 
 
 		 368 aa  165  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.408938 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0292  thiamine biosynthesis protein  38 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000151674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3179  thiamine biosynthesis protein  36.59 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0710  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  33.33 
 
 		 341 aa  50.1  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2037  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  27.89 
 
 		 359 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1753  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  27.89 
 
 		 359 aa  49.3  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0601571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0837  ExsB family protein  25.17 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0851  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  25.95 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0851  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  27.05 
 
 		 371 aa  46.2  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.273783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0088  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  28.43 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0120673 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2897  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  29.36 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0464  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  31.68 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000807441  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2564  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  22.78 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.15702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1189  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  24.24 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.189801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0722  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.03 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.161158  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21116  predicted protein  24.43 
 
 		 418 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01883  arginosuccinate synthetase (Eurofung)  31.96 
 
 		 416 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1938  hypothetical protein  24.34 
 
 		 212 aa  43.5  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.186563  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1718  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  26.61 
 
 		 367 aa  43.5  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.530012  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  41.18 
 
 		 397 aa  43.5  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0689  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  25.2 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>