30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0837 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0837  ExsB family protein  100 
 
 
261 aa  530  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265876  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1080  ExsB family protein  85.06 
 
 
261 aa  450  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1819  ExsB family protein  83.52 
 
 
261 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0902  ExsB family protein  62.45 
 
 
262 aa  340  1e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0037  ExsB family protein  50.96 
 
 
257 aa  251  7e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1107  putative ATP binding related protein  28.06 
 
 
302 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  26.15 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1718  hypothetical protein  28.4 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1498  hypothetical protein  25.68 
 
 
327 aa  48.1  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0801  ATP-binding protein  25.17 
 
 
324 aa  47.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0026  thiamine biosynthesis protein:ExsB  25.44 
 
 
326 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2075  thiamine biosynthesis protein:ExsB  24.32 
 
 
329 aa  47  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1992  hypothetical protein  26.32 
 
 
349 aa  46.2  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  27.03 
 
 
329 aa  45.8  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1624  hypothetical protein  26.32 
 
 
327 aa  45.8  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.425475  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1079  hypothetical protein  27.18 
 
 
279 aa  45.8  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1805  hypothetical protein  26.32 
 
 
327 aa  45.8  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1781  ExsB family protein  33.33 
 
 
268 aa  45.8  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762321  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1279  Queuosine synthesis-like protein  24.55 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1003  hypothetical protein  27.27 
 
 
257 aa  43.5  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.309072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4065  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25.33 
 
 
352 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1442  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  26.85 
 
 
339 aa  42.7  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00222564  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  28.48 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1064  exsB protein  40.58 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.704642  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1704  PP-loop domain protein  26.09 
 
 
285 aa  42.4  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0697664  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2054  asparagine synthase  25.32 
 
 
317 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2865  ExsB family protein  29.81 
 
 
278 aa  42.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000508984 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2218  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.04 
 
 
349 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005679 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2184  argininosuccinate synthase  24.78 
 
 
326 aa  42  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1979  thiamine biosynthesis protein:ExsB  26.9 
 
 
327 aa  42  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>