134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1529 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  100 
 
 
295 aa  607  1e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  81.97 
 
 
291 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  81.29 
 
 
291 aa  500  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  80.95 
 
 
291 aa  501  1e-141  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1107  putative ATP binding related protein  58.86 
 
 
302 aa  361  8e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  20.07 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  27.5 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 
2142 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  23.6 
 
 
355 aa  63.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1080  ExsB family protein  29.27 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  32.05 
 
 
390 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0837  ExsB family protein  26.15 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265876  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  26.67 
 
 
412 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  31.25 
 
 
380 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1819  ExsB family protein  26.35 
 
 
261 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0037  ExsB family protein  25.62 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  27.68 
 
 
380 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  30.66 
 
 
370 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  33.33 
 
 
392 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  26.62 
 
 
260 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1931  C32 tRNA thiolase  23.33 
 
 
295 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0797  PP-loop domain-containing protein  29.5 
 
 
334 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0613954  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  22.96 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  22.97 
 
 
345 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  30.83 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  34.12 
 
 
460 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  34.12 
 
 
460 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  28.77 
 
 
264 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  26.43 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  23.91 
 
 
315 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  23.61 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  23.61 
 
 
315 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1512  C32 tRNA thiolase  22.35 
 
 
293 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.8984 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  28.69 
 
 
268 aa  49.7  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  25.76 
 
 
302 aa  49.7  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  28.97 
 
 
274 aa  49.3  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  24.34 
 
 
362 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  30.51 
 
 
367 aa  49.3  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  30.51 
 
 
367 aa  49.3  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  26.32 
 
 
323 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3091  ExsB family protein  32.39 
 
 
382 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  22.76 
 
 
312 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  28.7 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14311  hypothetical protein  29.84 
 
 
370 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  26.09 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0902  ExsB family protein  22.45 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  25 
 
 
284 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  26.42 
 
 
274 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  26.88 
 
 
300 aa  47  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  26.92 
 
 
279 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  26.42 
 
 
274 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0699  PP-loop family protein  29.09 
 
 
243 aa  47  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.966834  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  26.85 
 
 
274 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0984  hypothetical protein  26.52 
 
 
329 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  26.85 
 
 
274 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1750  C32 tRNA thiolase  29.91 
 
 
368 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000779647 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  30.58 
 
 
378 aa  46.6  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1441  PP-loop domain-containing protein  26.92 
 
 
296 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  26.42 
 
 
274 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  26.42 
 
 
274 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  22.73 
 
 
289 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  23.13 
 
 
255 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  23.13 
 
 
255 aa  46.2  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  27.36 
 
 
274 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  24.79 
 
 
269 aa  46.2  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  27.78 
 
 
274 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  34.12 
 
 
378 aa  46.2  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  28.07 
 
 
302 aa  46.2  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  30.58 
 
 
378 aa  46.2  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  29.09 
 
 
316 aa  46.2  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  29.63 
 
 
317 aa  45.8  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  32.35 
 
 
376 aa  45.8  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  28.18 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  29.09 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  29.09 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  29.09 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  29.41 
 
 
513 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  25.96 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  28.75 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0184  ExsB family protein  33.87 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0478  PP-loop domain-containing protein  24.26 
 
 
296 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130396  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  29.63 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  25 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  23.19 
 
 
304 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0772  C32 tRNA thiolase  27.04 
 
 
381 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.26194  normal  0.702409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  29.2 
 
 
247 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0778  C32 tRNA thiolase  27.04 
 
 
381 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.344606  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  27.1 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  24.79 
 
 
417 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  22.79 
 
 
317 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0546  thiamine biosynthesis protein  29.55 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.193283  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1749  PP-loop family protein  27.27 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.10614  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02293  C32 tRNA thiolase  25.23 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1434  ExsB family protein  26.19 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.672941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  23.08 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003477  tRNA(Cytosine32)-2-thiocytidine synthetase  22.86 
 
 
297 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0168289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  21.71 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0974  PP-loop domain protein  25.5 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0928  PP-loop family protein  28.18 
 
 
252 aa  43.9  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  28.36 
 
 
402 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0184708 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>