31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1441 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1441  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 
296 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0359  PP-loop domain-containing protein  92.91 
 
 
296 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0478  PP-loop domain-containing protein  92.23 
 
 
296 aa  568  1e-161  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130396  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0546  thiamine biosynthesis protein  76.45 
 
 
299 aa  479  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.193283  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1249  hypothetical protein  54.92 
 
 
302 aa  330  2e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  33.91 
 
 
329 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  28.24 
 
 
291 aa  49.3  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  27.48 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  27.48 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  33.9 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  26.92 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2450  thiamine biosynthesis protein  30.71 
 
 
352 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  44.64 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  27.61 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1904  thiamine biosynthesis protein  28.36 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  24.38 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  32.32 
 
 
576 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  36.36 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6080  ExsB family protein  25.32 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  25.83 
 
 
323 aa  43.5  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2372  hypothetical protein  25.49 
 
 
357 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000114865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  37.08 
 
 
543 aa  43.5  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  32.65 
 
 
566 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  29.09 
 
 
539 aa  43.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  25.56 
 
 
300 aa  42.7  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  32.98 
 
 
540 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  31.63 
 
 
562 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6993  asparagine synthase  25.95 
 
 
470 aa  42.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0177  tRNA methyl transferase-like protein  26.67 
 
 
313 aa  42.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_4674  predicted protein  22.84 
 
 
252 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.594652  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0405  thiamine biosynthesis protein  27.73 
 
 
345 aa  42.4  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>