22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0478 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0478  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 
296 aa  610  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130396  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0359  PP-loop domain-containing protein  90.88 
 
 
296 aa  568  1e-161  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1441  PP-loop domain-containing protein  92.23 
 
 
296 aa  568  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0546  thiamine biosynthesis protein  77.47 
 
 
299 aa  482  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.193283  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1249  hypothetical protein  54.92 
 
 
302 aa  333  2e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  32.17 
 
 
329 aa  50.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  28.46 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  24.88 
 
 
326 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  27.69 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  27.69 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2372  hypothetical protein  26.32 
 
 
357 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000114865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  36.13 
 
 
268 aa  46.6  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1904  thiamine biosynthesis protein  30.91 
 
 
368 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  46.43 
 
 
237 aa  46.2  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  24.26 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2450  thiamine biosynthesis protein  29.92 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  25.79 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  28.18 
 
 
539 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0228  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  23.74 
 
 
473 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  24.63 
 
 
300 aa  43.1  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  25.83 
 
 
323 aa  42.7  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  42.59 
 
 
576 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>