113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1687 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  100 
 
 		 291 aa  600  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  97.25 
 
 		 291 aa  588  1e-167  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  97.25 
 
 		 291 aa  588  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  81.97 
 
 		 295 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1107  putative ATP binding related protein  58.39 
 
 		 302 aa  360  1e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  23.51 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  30.26 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  28.47 
 
 		 2142 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1080  ExsB family protein  27.56 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  39.44 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  24.16 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1819  ExsB family protein  26.22 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  27.57 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  26.85 
 
 		 412 aa  57  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  28.32 
 
 		 370 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  23.88 
 
 		 367 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  23.88 
 
 		 367 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  27.84 
 
 		 380 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  28.73 
 
 		 326 aa  53.1  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  33.33 
 
 		 392 aa  52.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  27.68 
 
 		 380 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14311  hypothetical protein  30.83 
 
 		 370 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0797  PP-loop domain-containing protein  29.5 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0613954  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0984  hypothetical protein  31.93 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  22.67 
 
 		 362 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  27.73 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  29.41 
 
 		 328 aa  49.7  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0902  ExsB family protein  22.61 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1931  C32 tRNA thiolase  23.64 
 
 		 295 aa  49.3  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  28.57 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  28.7 
 
 		 345 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  26.81 
 
 		 287 aa  48.9  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  29.63 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0037  ExsB family protein  23.9 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1441  PP-loop domain-containing protein  27.48 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  28.83 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0614  GMP synthase  33.71 
 
 		 524 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0478  PP-loop domain-containing protein  27.69 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0359  PP-loop domain-containing protein  25.58 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0546  thiamine biosynthesis protein  29.77 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.193283  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1512  C32 tRNA thiolase  24.67 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.8984 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  28.33 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1434  ExsB family protein  30.77 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.672941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  22.92 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3091  ExsB family protein  32.39 
 
 		 382 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  28.33 
 
 		 378 aa  47  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1750  C32 tRNA thiolase  30.84 
 
 		 368 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000779647 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0340  ExsB family protein  26.52 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  22.92 
 
 		 315 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  24.61 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3936  LPS biosynthesis protein WbpG  28.93 
 
 		 376 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.074215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  34.69 
 
 		 527 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2118  ExsB family protein  28.24 
 
 		 268 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  34.09 
 
 		 513 aa  46.2  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0699  PP-loop family protein  25.85 
 
 		 243 aa  46.2  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.966834  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  23.35 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  25.66 
 
 		 315 aa  45.8  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  24.08 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  27.5 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  25.96 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  36.84 
 
 		 460 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  36.84 
 
 		 460 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  33.67 
 
 		 527 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  25.45 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1016  GMP synthase  31.3 
 
 		 525 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.612801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  25.56 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14151  hypothetical protein  28.57 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  24.08 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  24.08 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0206  conserved hypothetical protein, putative ATPase (PP-loop superfamily)  27.93 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0778  C32 tRNA thiolase  29.38 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.344606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0934  GMP synthase  32.95 
 
 		 509 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0445641  normal  0.514334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  28.04 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  28.57 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0485  ExsB family protein  30.28 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  28.04 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  36.36 
 
 		 512 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1930  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  30.23 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000673217  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  20.57 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  24.04 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0772  C32 tRNA thiolase  29.38 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.26194  normal  0.702409 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1681  GMP synthase  34.74 
 
 		 529 aa  43.9  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  23.91 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  22.66 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  27.37 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  24.04 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  25.69 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  25 
 
 		 323 aa  43.5  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  27.19 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  40 
 
 		 522 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  27.35 
 
 		 402 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  24.63 
 
 		 269 aa  43.5  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  20.86 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  31.73 
 
 		 525 aa  43.1  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1245  GMP synthase  39.29 
 
 		 539 aa  43.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0352  PP-loop domain-containing protein  24.05 
 
 		 258 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  24.88 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  24.88 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  28.69 
 
 		 378 aa  42.7  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  22.9 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>