39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1603 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  751    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  34.1 
 
 		 355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0984  hypothetical protein  27.06 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  25.6 
 
 		 343 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  23.16 
 
 		 370 aa  86.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  23.32 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  25.6 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  25.19 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  24.64 
 
 		 345 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  28.96 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  25.13 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1977  hypothetical protein  22.1 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  24.09 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  24.09 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  25.87 
 
 		 417 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  32.23 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  27.2 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  22.67 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  31.46 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  22.09 
 
 		 291 aa  49.3  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0722  hypothetical protein  31.47 
 
 		 272 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  22.09 
 
 		 291 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  24.34 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3091  ExsB family protein  27.12 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  26.74 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 2142 aa  46.6  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  25.96 
 
 		 302 aa  46.6  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  28.92 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  24.58 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  28.92 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0530  LPS biosynthesis protein, PseA-like protein  26.51 
 
 		 440 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0107951  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1320  PP-loop domain-containing protein  41.79 
 
 		 324 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  24.02 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  30.65 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0797  PP-loop domain-containing protein  30.16 
 
 		 334 aa  43.1  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0613954  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1387  hypothetical protein  26.28 
 
 		 275 aa  43.1  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000185278  normal  0.88629 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14151  hypothetical protein  32 
 
 		 370 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  27.5 
 
 		 309 aa  42.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  30.91 
 
 		 246 aa  42.7  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>