30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20141 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  783    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14311  hypothetical protein  53.09 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  32.77 
 
 		 402 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08711  hypothetical protein  28.82 
 
 		 406 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484525  unclonable  0.0000000933108 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14911  hypothetical protein  30.05 
 
 		 455 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.061968 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  31.55 
 
 		 378 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0530  LPS biosynthesis protein, PseA-like protein  31.04 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0107951  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  30.99 
 
 		 378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  30.7 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  30.7 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  29.27 
 
 		 460 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  29.27 
 
 		 460 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01081  hypothetical protein  29.91 
 
 		 456 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.244523 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  33.88 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  33.88 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3936  LPS biosynthesis protein WbpG  29.22 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.074215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  25.88 
 
 		 417 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  24.79 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  26.22 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  38 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  41.57 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  26.89 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  34.41 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  29.09 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  26.6 
 
 		 355 aa  53.1  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  31.46 
 
 		 362 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  23.33 
 
 		 345 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  30.68 
 
 		 343 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3091  ExsB family protein  22.88 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  32.35 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>