27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_14151 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_14151  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  751    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3091  ExsB family protein  38.98 
 
 
382 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  34.77 
 
 
380 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  37.11 
 
 
412 aa  210  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  33.88 
 
 
380 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  33.7 
 
 
380 aa  202  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  25.84 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  27.6 
 
 
370 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  30.77 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  25.43 
 
 
368 aa  63.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  29.81 
 
 
378 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  29.81 
 
 
378 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  25.73 
 
 
392 aa  57  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  29.81 
 
 
378 aa  57  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  31.13 
 
 
378 aa  55.5  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  27.86 
 
 
345 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  27.33 
 
 
291 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  34 
 
 
362 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  29.91 
 
 
2142 aa  49.3  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  28.07 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  29.57 
 
 
291 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3936  LPS biosynthesis protein WbpG  31.36 
 
 
376 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.074215 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  30.95 
 
 
367 aa  46.2  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  30.95 
 
 
367 aa  46.2  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  27.17 
 
 
295 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08711  hypothetical protein  25.23 
 
 
406 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484525  unclonable  0.0000000933108 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  36.49 
 
 
376 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>