35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0258 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  100 
 
 		 367 aa  771    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  100 
 
 		 367 aa  771    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  37.53 
 
 		 378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  36.19 
 
 		 378 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  36.19 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  35.92 
 
 		 378 aa  219  7e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3936  LPS biosynthesis protein WbpG  33.07 
 
 		 376 aa  202  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.074215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  32.45 
 
 		 417 aa  186  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  33.88 
 
 		 376 aa  175  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08711  hypothetical protein  31.38 
 
 		 406 aa  146  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484525  unclonable  0.0000000933108 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14311  hypothetical protein  29.4 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  27.89 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  26.84 
 
 		 390 aa  143  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  28.8 
 
 		 402 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14911  hypothetical protein  29.87 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.061968 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  28.84 
 
 		 460 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  28.84 
 
 		 460 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0530  LPS biosynthesis protein, PseA-like protein  29.35 
 
 		 440 aa  122  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0107951  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01081  hypothetical protein  28.46 
 
 		 456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.244523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  25 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  27.27 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  23.8 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  35.77 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  31.39 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  33.67 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  28.46 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  22.01 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  27.53 
 
 		 412 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  24.09 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  23.88 
 
 		 291 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 2142 aa  53.5  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  23.88 
 
 		 291 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  21.56 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1977  hypothetical protein  30.56 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  30.51 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>