39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2392 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  100 
 
 		 392 aa  819    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  50.54 
 
 		 390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  34.67 
 
 		 378 aa  200  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  34.67 
 
 		 378 aa  200  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  34.96 
 
 		 378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  34.1 
 
 		 378 aa  199  9e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  31.32 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  27.89 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  27.89 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3936  LPS biosynthesis protein WbpG  29.01 
 
 		 376 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.074215 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08711  hypothetical protein  30.43 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484525  unclonable  0.0000000933108 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14311  hypothetical protein  24.21 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  26.22 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  30.38 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  30.38 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0530  LPS biosynthesis protein, PseA-like protein  28.77 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0107951  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14911  hypothetical protein  26.42 
 
 		 455 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.061968 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01081  hypothetical protein  26.16 
 
 		 456 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.244523 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  24.16 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  28.49 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  23.53 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  27.37 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  25.19 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  20.79 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  25.13 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  29.93 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3091  ExsB family protein  24.67 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  24.46 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  25.84 
 
 		 345 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  25.18 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14151  hypothetical protein  25.43 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  23.78 
 
 		 2142 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  33.33 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  33.33 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  33.33 
 
 		 295 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  32.05 
 
 		 291 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3933  hydrolase  34.23 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158663  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1107  putative ATP binding related protein  27.72 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0984  hypothetical protein  24 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>