35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1511 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  100 
 
 
378 aa  779    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  85.19 
 
 
378 aa  677    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  99.47 
 
 
378 aa  776    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  97.62 
 
 
378 aa  764    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  34.58 
 
 
417 aa  225  8e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  37.96 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  35.92 
 
 
367 aa  219  7e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  35.92 
 
 
367 aa  219  7e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3936  LPS biosynthesis protein WbpG  35.16 
 
 
376 aa  210  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.074215 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14311  hypothetical protein  33.43 
 
 
370 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  34.67 
 
 
392 aa  200  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  30.7 
 
 
376 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08711  hypothetical protein  32.19 
 
 
406 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484525  unclonable  0.0000000933108 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  30.36 
 
 
402 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  29.32 
 
 
460 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  29.4 
 
 
460 aa  159  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0530  LPS biosynthesis protein, PseA-like protein  28.76 
 
 
440 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0107951  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14911  hypothetical protein  27.84 
 
 
455 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.061968 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01081  hypothetical protein  28.46 
 
 
456 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.244523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  24.03 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  27.91 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  23.27 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  33.33 
 
 
380 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  24.47 
 
 
412 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  25 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  31.67 
 
 
380 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14151  hypothetical protein  29.81 
 
 
370 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3091  ExsB family protein  26.04 
 
 
382 aa  50.4  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 
2142 aa  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  34.25 
 
 
355 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  27.5 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  34.12 
 
 
295 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  27.5 
 
 
291 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1977  hypothetical protein  34.15 
 
 
377 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  26.67 
 
 
291 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>