27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3091 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3091  ExsB family protein  100 
 
 		 382 aa  798    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  46.88 
 
 		 412 aa  346  4e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  42.78 
 
 		 380 aa  319  6e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  39.27 
 
 		 380 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  38.14 
 
 		 380 aa  256  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14151  hypothetical protein  43.71 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  23.05 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  23.62 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  29.73 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  24.67 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  33.61 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  27.22 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  27.66 
 
 		 345 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  26.63 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  26.04 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  23.02 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  27.12 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  32.39 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  22.88 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  33.8 
 
 		 291 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  32.39 
 
 		 291 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  32.39 
 
 		 291 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  23.18 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  30.25 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0226  GMP synthase subunit B  28.12 
 
 		 302 aa  44.3  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.612389  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3277  NAD+ synthetase  34.95 
 
 		 554 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 		 2142 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>