54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3258 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  720    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  34.1 
 
 		 362 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0984  hypothetical protein  26.81 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  26.93 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  21.58 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  21.92 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  20.79 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  33.67 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  33.67 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  21.71 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  23.6 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0530  LPS biosynthesis protein, PseA-like protein  27.67 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0107951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  24.34 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  24.72 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  24.16 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  24.16 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  27.32 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  34.95 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  34.95 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  34.96 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  20.33 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08711  hypothetical protein  37.5 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484525  unclonable  0.0000000933108 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14911  hypothetical protein  25.93 
 
 		 455 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.061968 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  26.6 
 
 		 376 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  31.15 
 
 		 315 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1107  putative ATP binding related protein  26.2 
 
 		 302 aa  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  24.44 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01081  hypothetical protein  25.6 
 
 		 456 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.244523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  23.81 
 
 		 380 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  34.25 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  30.89 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0689  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  26.01 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  34.25 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  26.77 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  26.23 
 
 		 332 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  27.37 
 
 		 303 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  27.42 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3936  LPS biosynthesis protein WbpG  35.23 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.074215 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  34.71 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0546  thiamine biosynthesis protein  26.91 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.193283  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3091  ExsB family protein  23.18 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  34.25 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  29.82 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  31.51 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  29.82 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14311  hypothetical protein  24.89 
 
 		 370 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1441  PP-loop domain-containing protein  36.36 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  23.38 
 
 		 318 aa  44.3  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  23.08 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  30.77 
 
 		 309 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  29.25 
 
 		 319 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6854  GMP synthase  29.41 
 
 		 512 aa  43.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.727816  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4116  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.74 
 
 		 402 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  26.06 
 
 		 297 aa  42.7  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>