30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_14311 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_14311  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  769    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  53.09 
 
 
376 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  35.65 
 
 
378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  33.98 
 
 
378 aa  209  5e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  33.7 
 
 
378 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  33.43 
 
 
378 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  31.79 
 
 
402 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08711  hypothetical protein  31.44 
 
 
406 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484525  unclonable  0.0000000933108 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14911  hypothetical protein  32.16 
 
 
455 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.061968 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  30.48 
 
 
460 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  30.48 
 
 
460 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0530  LPS biosynthesis protein, PseA-like protein  29 
 
 
440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0107951  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3936  LPS biosynthesis protein WbpG  31.96 
 
 
376 aa  166  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.074215 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01081  hypothetical protein  29.35 
 
 
456 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.244523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  27.35 
 
 
417 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  29.4 
 
 
367 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  29.4 
 
 
367 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  25 
 
 
390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  24.21 
 
 
392 aa  125  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  28.68 
 
 
380 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  24.24 
 
 
380 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  23.15 
 
 
343 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  23.08 
 
 
368 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  30.83 
 
 
291 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  24.24 
 
 
380 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  30.83 
 
 
291 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  30.83 
 
 
291 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  29.84 
 
 
295 aa  47.8  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  26.09 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  24.89 
 
 
355 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>