34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3122 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  100 
 
 		 380 aa  798    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  45.04 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  42.78 
 
 		 380 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3091  ExsB family protein  42.78 
 
 		 382 aa  319  6e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  41.91 
 
 		 412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14151  hypothetical protein  34.32 
 
 		 370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  27.4 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  24.59 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  25.42 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  26.74 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  28.49 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  26.9 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  23.27 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  24.02 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  25.21 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  22.16 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  29.93 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14311  hypothetical protein  28.68 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  22.01 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  22.01 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  29.09 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  27.12 
 
 		 291 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  27.84 
 
 		 291 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  27.84 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  30.83 
 
 		 295 aa  51.6  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  32.23 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  29.2 
 
 		 402 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3936  LPS biosynthesis protein WbpG  32.26 
 
 		 376 aa  49.7  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.074215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1977  hypothetical protein  28.69 
 
 		 377 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01081  hypothetical protein  27.42 
 
 		 456 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.244523 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  23.28 
 
 		 2142 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  29.36 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  29.36 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08711  hypothetical protein  21.84 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484525  unclonable  0.0000000933108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>