45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2049 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  100 
 
 		 343 aa  705    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  30.6 
 
 		 345 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  26.32 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  27.58 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  28.11 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1977  hypothetical protein  28.21 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  26.93 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  25.6 
 
 		 362 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  23.84 
 
 		 2142 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  24.21 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  23.51 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  27.37 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  23.51 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  25.42 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  24.73 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1107  putative ATP binding related protein  24.81 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  20.07 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  28.78 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0984  hypothetical protein  25.95 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  21.24 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  26.88 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  28.46 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  28.46 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  25 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  25 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  24.46 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  26.43 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  26.89 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14151  hypothetical protein  29.91 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14311  hypothetical protein  23.15 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3091  ExsB family protein  33.61 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  30.68 
 
 		 376 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08711  hypothetical protein  25.95 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484525  unclonable  0.0000000933108 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3936  LPS biosynthesis protein WbpG  22.33 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.074215 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  25.96 
 
 		 460 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0530  LPS biosynthesis protein, PseA-like protein  24.42 
 
 		 440 aa  47  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0107951  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  25.96 
 
 		 460 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  24.26 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  37.5 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1629  PP-loop domain-containing protein  28.48 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1555  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  27.51 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.168737  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0797  PP-loop domain-containing protein  29.51 
 
 		 334 aa  43.5  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0613954  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  23.66 
 
 		 1053 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14911  hypothetical protein  27.88 
 
 		 455 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.061968 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1114  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.36 
 
 		 417 aa  42.7  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0822323  normal  0.384948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>